当前，新冠疫情防控进入了新阶段。随着防疫措施逐步调整，对当前疫情的规模和走向进行科学评估与预测，将对指导公众和公共卫生系统应对此次疫情具有重要价值。中国工程院院士、上海交通大学医学院教授陈赛娟对《中国科学报》说。
为此，她和合作者对上海地区2022年秋冬季的感染者随机抽样，进行了新冠病毒基因组测序与分子流行病学分析，持续监测国内流行的新冠病毒种类，同时评估每个变异株的感染力和致病力，判断疫情发展情况。
近日，陈赛娟团队与上海市公共卫生临床中心（以下简称上海公卫中心）范小红团队联合在《医学前沿》发表研究论文《初步分析我国2022年秋冬新冠疫情中奥密克戎亚型多样性与流行病学特征》。为此《中国科学报》采访了陈赛娟，请她对该研究进行了解读。我们从2022年秋冬期间上海公卫中心收治的患者中，随机抽取了378例样本，对其进行基因组测序，获得了369个高质量新冠病毒全基因组序列。
分子进化树分析发现，这些病毒基因组中共包含全球共享流感数据倡议组织（GISAID）数据库里记录的30个奥密克戎亚型毒株，其中355个（95.95%）基因组序列集中在5个奥密克戎亚系，主要毒株包括已在北京和广州等地流行的BF.7和BA.5.2，以及近期欧美地区出现的BQ.1和XBB。
我们的研究团队依据公开信息，对此波疫情（截至2022年11月29日）的重症/危重症患者数和感染者总数变化情况进行了分析，发现重症/危重症人数随感染者人数增长而增加，比例达到0.035%。这是根据此波疫情初发阶段数据得出的比例，随着近期疫情的发展，高危人群受累的程度不断增加，这个比例有可能会增高。
基于此前北京、广州、上海、重庆等地常规核酸检测的感染者数据，我们初步判断在上述主要城市，此轮奥密克戎疫情感染高峰于2023年元旦前后接近尾声。然而，重庆市主城区和郊区数据的数学模拟分析提示，疫情峰值在郊区有所延后，在春运期间，其感染峰值将因疫情扩散加速而显著增高。
对四川、陕西、甘肃、青海等地非省会城市人群中疫情进展情况进行预测，由于春运人员流动增加，估计在农村和中小城镇地区的感染峰值将于2023年1月中旬左右出现。
从我们的分析结果中能得出如下几个结论：第一，当前有多个奥密克戎亚型在国内同时传播；第二，近期出现新冠病毒感染症状的人群中，重症主要集中在有基础疾病的老年人群体中；第三，元旦后到春节期间，新冠疫情将主要影响农村和中小城镇地区；第四，春运期间城市和农村人口的流动将极大影响疫情走向。
由于农村和中小城镇地区的医疗资源相对匮乏，且有大量老年人和有基础疾病人群，所以当前急需为应对奥密克戎疫情向农村地区扩散启动应急计划，将更多医疗资源配置到农村基层，做好有效药物和新型疫苗的应急使用许可。除了已批准上市的Paxlovid和阿兹夫定外，我国自主研发的VV116已被证实安全有效，期待能得到药监部门紧急使用授权。