疫情暴发后,想要控制疾病传播,最重要的莫过于将病毒检测的假阴性率降至最低。在今天刊登的几篇日记中,史隽老师记录分析了关于病毒检测的诸多信息。
3月25日周三,MA累计确诊1838例。昨晚睡觉前听到哥伦比亚大学著名流行病学家W. Ian Lipkin感染了新冠病毒的消息,非常震惊。Lipkin教授被称为世界领先的“病毒猎人”。他还是史蒂文·索德伯格2011年的电影《传染病》的首席科学顾问。
在2003年非典时期,他受中国科学家和政府官员的邀请来到中国,帮助制定了控制病毒传播和减少感染的策略。2003年4月,他直接从患者的肺组织中测序出一段SARS冠状病毒 (SARS-CoV-1) 的序列并且研发出了首个针对SARS冠状病毒的敏感诊断测试。钟南山院士就是在他的建议下,把非典定义为病毒感染,改变了国内按细菌来治疗的政策。
非典过后,他与中国的科学家和政府官员紧密合作,帮助中国加强公共卫生体系。他帮助建立了上海的巴斯德研究所、北京的新国家疾病控制中心和广州市生物医学与健康研究所。这次1月底2月初,他也去了中国。虽然不能去武汉,还是在广州和北京呆了一段时间。
3月26日周四,MA累计确诊2417例。Trump昨天发了一条twitter,说:“到目前为止,美国做的‘新冠病毒测试’已经远远超过任何其他国家!
实际上,在过去八天的时间里,美国进行的测试要比韩国(过去被认为是非常成功的测试的国家)在八周的时间内做的测试更多。”在之后的新闻发布会上,他又把这点说了好几遍。然而,总统做的比较并不科学。流行病学家做比较通常使用的是人均检测率,测试的绝对数量不是很有意义。尽管美国在冠状病毒检测的总数上超过了韩国,但鉴于美国人口是韩国的六倍多,因此美国的人均检测量却少得多。
截至昨天 (3月25日),根据韩国CDC的报告, 5100万人口的韩国进行了357,896项新冠病毒测试。相比之下,美国基本属于各州自治,每个州单独统计汇报自己的测试数据,有几个州不报告阴性结果数量或结果待定的测试数量,所以很难准确地统计美国到底有多少人接受了新冠病毒测试。
《大西洋》杂志的撰稿人Alexis Madrigal领导了一个有100多名成员的义工小组,汇总了各州政府网站和政府官员提供的数据,汇报在Covid Tracking Project上。根据他们的统计,截至昨天 (3月25日), 3.29亿人口的美国进行了至少418,810项新冠病毒测试。
3月27日周五,MA累计确诊3240例。
FDA又紧急批准使用了一个新的检测方法:由雅培 (Abbott) 公司开发的、目前最快的新冠病毒测试 (Abbott ID NOW COVID-19 test),阳性结果5分钟可以读出,阴性结果13分钟可以读出,而且体积小巧便携,几乎可以在任何医疗环境中使用。该技术基于雅培的ID Now平台。
这个平台是美国目前最常用的即时检验仪器,全美大约有18,000多个这样的重量不到7磅的小机子,广泛用于检测流感、链球菌性喉炎 (strep throat) 和呼吸道合胞病毒 (respiratory syncytial virus,一种引起感冒症状的常见病毒)。上周,雅培公司的m2000 RealTime系统也获得了美国FDA的紧急批准使用,用于医院和分子实验室诊断感染。
这个系统每周最多可以进行100万次测试,但是需要的时间更长。雅培公司计划从4月1日开始每天提供50,000个ID Now测试,两个系统加起来,每月至少提供500万次测试。ID Now系统是雅培公司2016年2月份收购的Alere公司开发的。
其检测原理是:将病人的鼻或咽拭子样本与化学溶液混合,病毒破裂从而释放RNA;将这个混合物插入ID Now系统中,通过等温核酸扩增技术结合转录介导,可以定性测微量的RNA,扩增大约150碱基的小段,这一小段是新冠病毒的特异序列,不同于其他病毒。如果样本里面有新冠病毒,扩增5分钟以后就能产生足够的信号,可以判断为阳性。而如果扩增13分钟以后仍然没有信号可以判断为阴性。