117疫情观察 | 史隽·波士顿篇·Ⅱ

作者: 史隽

来源: 返朴

发布日期: 2020-04-05 08:40:04

本文记录了史隽老师在疫情期间对病毒检测方法的分析和相关信息的记录,包括对Lipkin教授的介绍、美国和韩国的病毒检测率比较、以及雅培公司开发的新型快速检测方法。

疫情暴发后,想要控制疾病传播,最重要的莫过于将病毒检测的假阴性率降至最低。在今天刊登的几篇日记中,史隽老师记录分析了关于病毒检测的诸多信息。

3月25日周三,MA累计确诊1838例。昨晚睡觉前听到哥伦比亚大学著名流行病学家W. Ian Lipkin感染了新冠病毒的消息,非常震惊。Lipkin教授被称为世界领先的“病毒猎人”。他还是史蒂文·索德伯格2011年的电影《传染病》的首席科学顾问。

在2003年非典时期,他受中国科学家和政府官员的邀请来到中国,帮助制定了控制病毒传播和减少感染的策略。2003年4月,他直接从患者的肺组织中测序出一段SARS冠状病毒 (SARS-CoV-1) 的序列并且研发出了首个针对SARS冠状病毒的敏感诊断测试。钟南山院士就是在他的建议下,把非典定义为病毒感染,改变了国内按细菌来治疗的政策。

非典过后,他与中国的科学家和政府官员紧密合作,帮助中国加强公共卫生体系。他帮助建立了上海的巴斯德研究所、北京的新国家疾病控制中心和广州市生物医学与健康研究所。这次1月底2月初,他也去了中国。虽然不能去武汉,还是在广州和北京呆了一段时间。

3月26日周四,MA累计确诊2417例。Trump昨天发了一条twitter,说:“到目前为止,美国做的‘新冠病毒测试’已经远远超过任何其他国家!

实际上,在过去八天的时间里,美国进行的测试要比韩国(过去被认为是非常成功的测试的国家)在八周的时间内做的测试更多。”在之后的新闻发布会上,他又把这点说了好几遍。然而,总统做的比较并不科学。流行病学家做比较通常使用的是人均检测率,测试的绝对数量不是很有意义。尽管美国在冠状病毒检测的总数上超过了韩国,但鉴于美国人口是韩国的六倍多,因此美国的人均检测量却少得多。

截至昨天 (3月25日),根据韩国CDC的报告, 5100万人口的韩国进行了357,896项新冠病毒测试。相比之下,美国基本属于各州自治,每个州单独统计汇报自己的测试数据,有几个州不报告阴性结果数量或结果待定的测试数量,所以很难准确地统计美国到底有多少人接受了新冠病毒测试。

《大西洋》杂志的撰稿人Alexis Madrigal领导了一个有100多名成员的义工小组,汇总了各州政府网站和政府官员提供的数据,汇报在Covid Tracking Project上。根据他们的统计,截至昨天 (3月25日), 3.29亿人口的美国进行了至少418,810项新冠病毒测试。

3月27日周五,MA累计确诊3240例。

FDA又紧急批准使用了一个新的检测方法:由雅培 (Abbott) 公司开发的、目前最快的新冠病毒测试 (Abbott ID NOW COVID-19 test),阳性结果5分钟可以读出,阴性结果13分钟可以读出,而且体积小巧便携,几乎可以在任何医疗环境中使用。该技术基于雅培的ID Now平台。

这个平台是美国目前最常用的即时检验仪器,全美大约有18,000多个这样的重量不到7磅的小机子,广泛用于检测流感、链球菌性喉炎 (strep throat) 和呼吸道合胞病毒 (respiratory syncytial virus,一种引起感冒症状的常见病毒)。上周,雅培公司的m2000 RealTime系统也获得了美国FDA的紧急批准使用,用于医院和分子实验室诊断感染。

这个系统每周最多可以进行100万次测试,但是需要的时间更长。雅培公司计划从4月1日开始每天提供50,000个ID Now测试,两个系统加起来,每月至少提供500万次测试。ID Now系统是雅培公司2016年2月份收购的Alere公司开发的。

其检测原理是:将病人的鼻或咽拭子样本与化学溶液混合,病毒破裂从而释放RNA;将这个混合物插入ID Now系统中,通过等温核酸扩增技术结合转录介导,可以定性测微量的RNA,扩增大约150碱基的小段,这一小段是新冠病毒的特异序列,不同于其他病毒。如果样本里面有新冠病毒,扩增5分钟以后就能产生足够的信号,可以判断为阳性。而如果扩增13分钟以后仍然没有信号可以判断为阴性。

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