新型冠状病毒(SARS-CoV-2)到底从哪里来一直是大家关心的问题。
SARS-CoV-2溯源相关的论文看得人眼花缭乱,有和从动物身上分离到的病毒核酸序列做比对的,有将分离于病人的病毒核酸序列进行综合比对分型的……3月17日,美国加州Scripps研究所(The Scripps Research Institute)研究员克里斯蒂安·安德森(Kristian G. Andersen)等来自美国、英国和澳大利亚的五位学者在《自然·医学》(Nature Medicine)发表通信文章,对与SARS-CoV-2研究相关的论文做了梳理,提出SARS-CoV-2来源的两种可能:1)感染人之前在动物宿主发生了自然选择;2)在人群中传播时进行自然选择。
现已明确,SARS-CoV-2通过刺突蛋白(Spike protein)与人细胞表面的ACE2受体结合入侵宿主细胞。该刺突蛋白由S1亚基和S2亚基构成,两者之间有一个4个氨基酸组成的多元切割位点,并有3个多糖环绕;刺突蛋白与ACE2受体结合的部位位于S1亚基,其中的6个氨基酸起关键作用。
新冠肺炎疫情最早期确诊的患者多数与武汉海鲜市场有交集,后有研究报道指出SARS-CoV-2的核酸序列与分离于蝙蝠的RaTG13毒株的核酸序列相似度高达96%:这都能让人联想到SARS-CoV-2可能源于动物。
此前的研究显示,RaTG13毒株刺突蛋白ACE2受体结合区域的6个关键氨基酸只有1个与SARS-CoV-2的相同,而分离于穿山甲的SARS-CoV样冠状病毒(SARS-CoV-like coronaviruses)的6个关键氨基酸与SARS-CoV-2的完全相同。本文作者指出,从这个角度来讲,SARS-CoV-2的前体可能在动物体内进行了自然选择,最后获得和与人体细胞高度亲和的能力。
分离于穿山甲的SARS-CoV样病毒的受体结合区域具有与SARS-CoV-2一样的6个核心氨基酸,但是没有多元切割位点。为此,作者提出了另外一个SARS-CoV-2形成的方式:SARS-CoV-2前体从动物(比如穿山甲)传播到人,在人群中进一步传播时获得另外的结构(比如说多元切割位点),最终演化成SARS-CoV-2。
作者最后指出,明确SARS-CoV-2到底是在动物身上形成的还是人身上形成的对于我们预防类似疾病的发生有很重要的帮助作用。但不管怎么说,从我们现在掌握的SARS-CoV-2的信息来看,它不可能源于生物实验室。