在一个‘被遗忘的实验’中,生物学家们发起了预印本革命——而这发生在50年前!

作者: Jocelyn Kaiser

来源: 科研圈

发布日期: 2017-10-08 10:44:23

生物学家们在60年代发起了预印本革命,比arXiv早三十年。这一项目由美国国立卫生研究院(NIH)创立,旨在促进科学家之间的交流,分享研究结果。然而,由于商业和非营利性期刊出版商的强烈反对,该项目最终在出版商的压力下关闭。尽管如此,这一历史性的事件为后来的预印本服务如arXiv和bioRxiv奠定了基础。

在一个‘被遗忘的实验’中,生物学家们发起了预印本革命——那比 arXiv 还要早三十年。

Jocelyn Kaiser 中科院物理所 2017-10-08 10:44:23 转自公众号:科研圈 http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzA5NDkzNjIwMg==&mid=2651665501&idx=2&sn=4039d475e66f431a08824f9241d91151 本文由微信公众号“科研圈”(ID:keyanquan)授权转载。

转载请先联系 keyanquan@huanqiukexue.com 作者 Jocelyn Kaiser 来源 science 翻译 梁珩 审校 阿金 Francis Crick(图左)起初对美国国立卫生研究院(National Institute of Health, NIH)60年代的预印本分享项目持怀疑态度,但是后来他加入这个预印本交流团体,团体领导为 James Watson(就是生物书上那位发现DNA双螺旋结构的大牛!

) 图片收录于冷泉港实验室(Cold Spring Harbor Laboratory)。

随着更多的生物学者们正式在云端上分享他们未经同行评审或期刊发表的论文,我们常说这是在跟上物理学者的步伐,因为物理学者从1991年就开始在在线服务 arXiv 上这么干了。但事实上,生物医学学者才是最早的发起人,因为有学者在研究一个“被遗忘的项目”时发现,早在60年代 NIH 就创立了一个预印本交流项目,但它最终在出版商的压力下关闭了。

英国曼切斯特大学(University of Manchester in the United Kingdom)的生物学家及科学史学者 Matthew Cobb 在浏览当时纽约冷泉港实验室 Cold Spring Harbor Laboratory(CSHL) 的两位生物学家 Francis Crick 和 Sydney Brenner 交流的信件时,发现对这一项目有所提及。

“于是我顺藤摸瓜”他告诉 Science Insider,发现自1961年起,一位70岁的 NIH 行政人员 Errett Albritton 成立了信息交换小组(Information Exchange Groups,IEGs),小组成员则为一些来自相同子领域且对此感兴趣的科学家。

根据 Cobb 自己于8月22日发表在 PeerJ 上的文章草稿,当时的参与者把论文草稿和其它资料发给 NIH 来筛选,NIH 再把文章的复印件发到这个小组。与今日的预印本类似,这是为了在文章发表前的数个月促进科学家之间的交流,分享研究结果。

Cobb 谈到,Albritton 首先找到了 Crick,而当时 Crick 拒绝了 IEG 建立 DNA 编码领域小组的邀请“因为在这个领域的各项研究已充斥着太多的粗心大意和未充分交流,所以扩大这个项目,甚至是以一个半公开的方式,也令我感到恐慌,”Crick 回信说,即便他自己是 RNA 链俱乐部(RNA Tie Club)的成员,这是一个非正式,供一些研究核糖核酸结构的生物学家分享未出版论文手稿的小组织。

后来 Crick 抛开起初的怀疑,加入了 IEG 的‘Nucleic Acids and the Genetic Code(核酸和基因编码)’小组,而这一小组由 James Watson 共同领导,他们两人共同发现了 DNA 双螺旋结构。5年间,NIH 成立了7个交流小组,其中包括3663位来自美国和海外的科学家,总共交换了2561篇预印本论文——其中超过半数的文章还未被期刊进行同行评议。

这些预印本是保密的,但经作者允许可以供小组成员以外的人浏览。Cobb 写道,因为商业和非营利性期刊出版商的反对使得这个项目不复存在。1966年美国免疫学者协会(American Association of Immunologists)称 IEG 为“免疫学期刊的真正威胁”,并认为“IEG 最终会取代免疫学期刊”。

Nature 强烈反对 NIH 的做法,以及物理学家们类似的做法,后者最终成为了 arXiv。一位 Nature 的编辑公开批评预印本“高不可攀,内容反复,言辞粗鄙,稂莠不齐,评判不利”,同时声称浪费在“Allbritton 的打印店”上的钱应该用来支持商业期刊。

Science,作为 Science Insider 的出版商也持反对意见:当时的编辑 Philip Abelson 称 IEG 的文章是“政府下属部门的伪劣作品。”最后一波反对的浪潮发生在1966年末,当时13家生化期刊共同禁止收录在 IEG 分享过的文章。

NIH 宣布将会很快关闭 IEG,因为它无法承担其费用(每份预印本的复印件成本为10到50美分,1967年估计总花费约40万美元,约等价于现在的3百万美元)。威斯康星大学麦迪逊分校的生物化学家 David Green 曾担任 IEG 的首位领导者,迟些时候他公开批评这是对“科学交流史上最具革命性的创新之一”的“绞杀”。

到了1999年,癌症生物学家,当时的 NIH 院长 Harold Varmus 提出一项由 NIH 资助的预印本服务 E-biomed,而这一设想被出版商再一次扼杀。

但是,业界的观点随着2013年 PeerJ 预印本服务和 CSHL 赞助的预印本服务 bioRxiv 的出现而有所改变:“现在没有了60和90年代那种敌意,” Cobb 写道,部分原因在于通过开源期刊免费分享数据和想法的趋势,使得文章能通过网络迅速地被免费阅读。“一个可能的解释是…网络时代拒绝预印本,这看上去十分地野蛮吧!”

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