目前中央财政民口科技投入中，基础研究比例约占15%；美国联邦政府民口科技投入中超过50%用于基础研究。中科院院士高鸿钧委员建议：逐步加大基础研究投入强度，争取到2020年中央财政科技投入中基础研究的比例翻一番，提高到30%。
高鸿钧表示，国务院最近印发的《关于深化中央财政科技计划（专项、基金等）管理改革的方案》做出重大改革。能否通过本轮改革，进一步增强基础研究在创新驱动中的核心引领作用，将深刻影响我国科技事业和经济社会发展。
对原来的计划体系，既不全盘推翻，也不只换马甲，关键是优化结构，提高效率。分类实施细则要在充分征求各方面意见基础上制定，按程序稳妥施行，切忌计划管理上‘齐步走’‘一刀切’。高鸿均建议梳理各大科技计划的成就和问题，分门别类制定改革方案，安排好新老计划和政策的衔接。
高鸿均说，1998年启动的973计划和2006年起部署的若干‘重大科学研究计划’，关系到国家未来核心竞争力的形成。建议《改革方案》的‘重点研发计划’中，继续加强对这些研究的支持，并给予动态调整。