神奇的镜像分子

作者: 约翰·斯彼克曼

来源: 科学世界

发布日期: 2024-03-17 10:46:35

文章详细介绍了镜像分子的概念及其在生物学和化学中的重要性,探讨了手性分子在生物反应中的特异性,以及L型和D型分子在生命化学中的不同作用。此外,文章还讨论了手性分子在实际应用中的潜在用途,如信息存储和人工甜味剂的开发。

神奇的镜像分子

将你的左手和右手放在一起看,它们显然是相同的,但又明显不同。如果你把双手的手心朝上并保持这种状态,然后把一只手放在另一只手的上面,你会发现,虽然左右手有着相同的特征,但它们并不重叠。实际上,它们是彼此的镜像。复杂的生物分子中也存在“手性”的特征。大多数有机分子都能以左手和右手的形式存在,被称为L型(左手性)和D型(右手性)。

这两个字母分别是Laevus和Dexter的缩写,是拉丁语中左和右的意思。但这一特征不叫左右手习惯(handedness),而是叫做“手性”(chirality)。每个分子的两种形式被称为“立体异构体”。

镜像分子是在约170年前由法国著名化学家路易·巴斯德(Louis Pasteur)首次发现的。

令人惊讶的是,这些镜像分子是D型还是L型,对其化学性质几乎没有影响——它们的溶解度相同,反应速度一样,熔点等性质也同样。但是,当涉及到生物学时,手性结构则能引起深刻的差异,因为地球上的生命通常只偏爱一种形式的分子。因此,酶在与这种形式的分子发生化学反应时最有效。当遇到L型分子时,为处理D型分子进化而来的酶往往完全不起作用,反之亦然。

生命化学的某些方面主要基于D型——如糖类和DNA的代谢,而其他方面则主要基于L型——如氨基酸的代谢。究竟为什么生命会有这种模式,仍是一个谜。当然,一旦有了酶系统,那么很显然它在进化过程中会保持固定不变,因为酶不能处理另外的手性形式。但为什么一开始糖化学主要是以D型为基础?长期以来,人们认为答案可能在于不同化合物之间反应能量的微小差异。

但这些差异几乎难以察觉,2019年,研究人员发现,这些反应能量的差异实在太小了,手性选择性不可能在前生物化学中发生。那么答案可能只有“偶然性”了。也许最初的生命是多手性的,但随着酶开始进化,它不得不向某个方向发展——而这个方向是随机的。糖类和DNA是D,氨基酸是L。如果生命从头开始重新进化,解决方案就可能会有所不同。

所有的生命都遵循相同的惯例,这一事实也有力地证明了地球上的所有生命是从一个做出手性选择的共同祖先演变而来的。如果有一天有人发现一个细菌或其他微生物在其生命的化学过程中使用了另一种手性,那将是一个惊人的发现。巴斯德本人曾推测这种具有镜像生物学的生物体可能存在。

化学物质的L型和D型之间的差异,以及生命的某些方面主要以L型为基础,而其他方面主要以D型为基础的事实,可能有一些实际的用处。

以葡萄糖为例,L-葡萄糖在自然界中不存在,但我们可以人工制造它。有些令人吃惊的是,L-葡萄糖和D-葡萄糖的味道一样甜。但L-葡萄糖不能用来提供能量,因为糖酵解途径中的第一种酶——磷酸化葡萄糖的己糖激酶,不能磷酸化L-葡萄糖。L-葡萄糖似乎可能是一种完美的人工甜味剂,然而事实证明它不是。

2021年8月的第一周,有一个让人赞叹不已的例子,说明使用手性可能有一些惊人的实际意义。

DNA的结构使其成为信息存储和恢复的理想生物分子。DNA的碱基配对排列和使用3个相邻碱基对的密码子来代表字母,使得它可以有效地在人工合成的DNA链上直接写下东西。随后,可以通过测序来读取这些信息。这里高效信息存储的潜力令人难以置信。一个细胞的细胞核包含的整个基因组约有30亿个碱基对,也就是约10亿个密码子。假设一本典型的书中包含约50万个字母,那么一个细胞核的DNA就相当于约2000本书。

一个细胞核的直径约为6微米,因此体积约为100立方微米。这意味着一块尺寸仅为1毫米×1毫米×1毫米的材料,可以包含1000万个细胞核,因此包含200亿本书的信息。这是很了不起的。自从有文字以来,总计只有约1.3亿本书被写出来。这个小小的DNA立方体可以包含有史以来所有书中150倍的信息量。显然,DNA具有惊人的信息存储潜力。但存在一个问题——它也很容易被能降解它的酶所攻击。

因此,作为一个信息存储的分子,它的容量很大,寿命却很短。但是,DNA是手性的。它是以D-核苷酸为基础的。如果我们能制造出L-DNA呢?从理论上讲,它应该能够抵抗自然产生的DNA酶的攻击——这些酶被设计为只消化D-DNA,而这将带来海量存储能力和长期稳定性的理想组合。

我们在地球上的“任期”是有时间限制的。最终我们的太阳会爆炸,地球上曾经存在的所有东西都会被蒸发掉。

逃离太阳系将是我们在这一终极事件中生存的唯一机会——即使我们在那之前设法没有自我毁灭。然而,太空殖民确实受到了巨大的空间上的阻碍。但是,还有一个替代方案。在太阳爆炸之前,我们可以把全部人类知识和关于我们和地球上的生命的所有信息保存在一小包L-DNA里,可能不到1千克,然后把它送入太空,而不是真正的人类穿越遥远的太空。

其中将包括如何阅读它的说明,以及如何从同一艘飞船上的冷冻卵子中重建人类和其他地球上的生命体。我们可以逃脱灭绝的命运,而不需要长途旅行。我们只是希望,如果那个未来的包裹降落在另一个星球上,并被外星生物发现,它们的生命不是基于L-DNA的。否则,这个包裹虽然可以在茫茫宇宙中跋涉数百万年,穿越亿万千米的空间,但最终却会在到达后第一天就被消化掉。

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