一定数量的、能够对人体健康产生有益作用的活微生物被称为益生菌。肠道是人体最大的微生态环境，正常的肠道菌群包含的微生物的种类超过400种。我们常说的肠道益生菌包括双歧杆菌、乳酸菌等，肠道内的菌群对于消化吸收及人体免疫都具有非常重要的功能。健康人体肠道内的菌群一般都维持在一个相对平衡的状态，但是饮食和精神因素、药物因素及年龄因素等都会造成肠道内菌群的失调。
其中，药物因素，比如大量服用广谱抗生素，确实可以在短时间内破坏肠道益生菌的平衡。
那么，是否可以培养具有耐药性的肠道菌种呢？从生物技术的角度来讲，这其实并不是很难实现的，只需要在含有相应抗生素的菌种板上筛选具有耐药性突变的单菌落并进行繁殖即可。但是，从人体健康的角度来讲，培养耐药性的菌种并不是一个现实可行的办法。首先，抗药性细菌会打破肠道本身的生态平衡，造成耐药菌株大量繁殖，甚至可能出现超级细菌。
其次，人体各个部位的菌群组成是不同的，肠道中正常的菌群在人体其他部位可能含量很少，甚至可能是致病菌，所以导入抗药性的肠道益生菌的菌种会带来很多意想不到的副作用，后果难以预料。
为避免服用抗生素引起菌群失调，在必须使用抗生素时，应该尽量避免大量服用广谱抗生素；在临床上可以进行药物敏感实验，选择最为敏感的抗生素，减少使用量；还需要注意的是，要严格按照抗生素的服用方法进行用药，控制好用量，不滥用抗生素。