耳念珠菌既可以引起人体感染症状，也可以只是在人体寄居。这种真菌如果进入血液，会导致严重的侵入性感染，其间，患者会出现典型的感染症状，如发烧。耳念珠菌也会寄居在人的皮肤、直肠、阴道或口腔等特定区域，但带菌者不会表现出感染症状，这种情况被称为“无症状定植”。耳念珠菌可以通过“无症状带菌者”感染其他人。
耳念珠菌可以通过直接或间接接触传播，如通过皮肤、衣服传播。耳念珠菌可寄生在人体各处，且能在环境中存活数周，并能在医疗机构中引起“爆发性”传播。如果诊断不准确、治疗不及时，患者病情会加重，并有死亡风险。
尽管大多数耳念珠菌感染可以用特定的抗真菌药物治疗，但耳念珠菌的耐药性可能是导致感染者死亡的一个重要因素。目前的临床和实验室研究发现，耳念珠菌具有多重耐药性。美国CDC数据显示，90%的感染者对至少一种抗真菌药物有耐药性，而30%的感染者至少对两种药物有耐药性。
目前，耳念珠菌的大多数菌株对氟康唑具有耐药性，不同菌株耐药性存在差异。在美国，约90%的耳念珠菌菌株对氟康唑具有耐药性，30%的菌株对两性霉素B具有耐药性，5%的菌株对棘白菌素具有耐药性。因此，对于多重耐药性的病例，可使用高剂量多种抗真菌药联合治疗。
从中国最早分离出的耳念珠菌的基因测序看，其与印度、巴基斯坦和法国等国的分离株亲缘关系较近，但与在多个国家发现的耳念珠菌的多重耐药表型不同。中国的耳念珠菌分离株对临床常用的抗真菌药物氟康唑、伊曲康唑、泊沙康唑、伏立康唑、两性霉素B、5-氟胞嘧啶、阿尼芬净、卡泊芬净和米卡芬净都比较敏感，说明这些药物对中国出现的耳念珠菌都具有疗效。另外，中国研究人员还发现，硫酸铜对耳念珠菌有很强的生长抑制作用。
这些研究结果为临床防治耳念珠菌感染提供了新的思路和方法。为防止耳念珠菌感染，可以在医院内使用硫酸铜进行消毒，以清除定植在院内的真菌。针对感染者，可以采用多种抗真菌药物，如氟康唑、伊曲康唑、两性霉素B和5-氟胞嘧啶等联用进行治疗。在日常生活中，应保持良好的个人卫生习惯，应勤洗手，保持室内和居家环境卫生，以预防耳念珠菌感染。