肠道菌群是⼈体内最重要的微⽣物之⼀，它在⼈体健康中发挥着关键作⽤。肠道菌群可以调节身体免疫系统，帮助身体消化⻝物和吸收养分，并与⼈体神经系统相互作⽤。近年来，研究发现肠道菌群对许多常⻅疾病的预防和治疗也有着深远影响，如炎症性肠病、哮喘、肥胖、糖尿病和⼼⾎管疾病等。科学家们正在探索如何通过饮⻝、益⽣菌和粪菌移植等⽅法来改善肠道菌群，从⽽提⾼⼈类健康⽔平。
新⽣⼉出⽣之后，会直接接触来⾃⺟体以及周围环境中的微⽣物，同时这些微⽣物快速地在婴⼉体内定植。此后在整个⽣命周期中，⼈体与微⽣物之间不断发⽣着各种相互作⽤，保持着⼀种互惠互利的关系。⼈体微⽣物数量是⼈体细胞数量的⼗⼏倍；⼈体中的微⽣物种类超过⼀万种，这其中，80%的微⽣物都集中在肠道。肠道微⽣物被称作是⼈类的第⼆⼤脑，会影响我们的胃⼝、⼼情甚⾄胖瘦。
肠道菌群和⼈体许多系统都存在着复杂的相互作⽤，能够发挥重要的⽣理功能。近年来还提出了脑-肠轴、肺-肠轴等概念。⼈体⾃身⽆法代谢⽔果蔬菜中的复杂多糖，这个功能是由肠道菌群替我们执⾏的，菌群代谢多糖，会产⽣多种⽣物活性物质，如短链脂肪酸、胆汁酸等。肠道菌群⾃身及其代谢产物会通过迷⾛神经影响⼤脑⽣理活动，⼤脑和肠道之间可以进⾏双向交流，所以菌群和⼤脑可谓息息相关。
肠道菌群分为三类，以双歧杆菌、乳酸杆菌等为代表的益⽣菌、以阴沟肠杆菌为代表的有害菌以及⼈畜⽆害的中性菌。健康状态下，⼈体与微⽣物之间保持着⼀种互惠互利的平衡状态。但是当肠道菌群发⽣紊乱失调时，致病菌就会异菌突起、益⽣菌就会急剧减少，平衡的状态便会被打破，导致各种疾病的发⽣。有95%的疾病和肠道微⽣物的紊乱相关，如精神类疾病、代谢性疾病、免疫疾病等。
肠道菌群和健康存在⾮常强的相关性，由此我们可以从保持肠道菌群平衡的⻆度出发，⽤全新的思路去保持健康。菌群状态与遗传、⽣活⽅式、饮⻝、⽤药情况均关系密切。我们已经开发出了以宏基因组为主的多组学检测⽅法，只需要⼀点点粪便样品，就可以得到被检⼈肠道菌群⾮常详细的信息，包括肠道菌群的种类、数量、功能情况等等。根据检测的结果，可以针对不同的个体，实施个性化精准治疗的⽅案。