十一届三中全会以后，随着改革开发的步伐，我国的科技事业进入了新的发展时期，迎来了“科学的春天”。40年间，中科院陆续建设了一大批科研装备：北京正负电子对撞机、国家同步辐射实验室、兰州重离子加速器国家实验室、500米口径球面射电望远镜（FAST）、蛟龙号载人潜水器、“墨子号”量子科学实验卫星。
取得了一大批重要的科研成果：“渤海粮仓”现代农业区域科技示范、体细胞克隆猴、实用化深紫外全固态激光器、人造单染色体真核细胞、中微子第三种振荡模式。科学技术是第一生产力，面向国民经济主战场，也是中科院科技工作的重要组成部分，为探索中国高技术企业发展积累了宝贵经验，加速了科技成果的转化。1980年，陈春先在中国科学院物理所办起了“北京等离子体学会先进技术发展服务部”。
1984年，中科院计算所11名科技人员创办了“联想”。1994年2月14日，联想集团有限公司在香港主板成功上市。1989年8月，中国科学院承担了“中关村教育与科研示范网络”（NCFC）工程。1990年，中科院高能所在中美实验室之间架设了专线。1994年4月20日，中国实现Internet的全功能连接。自此，奠定了中国互联网时代的基础。中科院研究所聚集的中关村，也成为了“高科技产业”的代名词。
仅“十八大”以来，中科院科技成果转移转化使社会企业新增销售收入1.7万亿元、利税2289亿元，院所投资企业营业收入1.7万亿元，上缴税金450多亿元。