dGTP激活SAMHD1四聚体结构机制研究获进展

来源: 中国科学院高能物理研究所

发布日期: 2013-11-28 13:40:08

国际期刊Nature Communications发表了中科院高能物理研究所多学科中心蛋白质结构中心龚勇研究员与天津大学生科院于晓方教授合作完成的研究成果——dGTP激活SAMHD1四聚体的结构机制研究。SAMHD1是一种新发现的抑制HIV的人源蛋白质分子,具有dNTPase活性,通过降解dNTP阻断HIV复制。研究报告了1.8埃分辨率的SAMHD1同源四聚体晶体结构,揭示了dNTP如何通过变构位点影响四聚体形成和酶活性。

近日,国际期刊Nature Communications发表了中科院高能物理研究所多学科中心蛋白质结构中心龚勇研究员与天津大学生科院于晓方教授合作完成的研究成果——dGTP激活SAMHD1四聚体的结构机制研究。SAMHD1是近年来新发现的抑制爱滋病毒(HIV)的人源蛋白质分子。Nature杂志在2011年同期发表了两篇论文,证明了SAMHD1是一个新的病毒抑制因子。

SAMHD1具有dNTPase活性,有可能通过降解反转录病毒复制所需要的原料dNTP,在某些细胞内阻断HIV的复制。目前这一蛋白质分子已经成为HIV研究领域的新热点。

最新发表的Nature Communications论文报告了高达1.8埃分辨率的SAMHD1同源四聚体晶体结构,高分辨率的晶体结构清晰地说明了dNTP是如何通过变构位点将四个分子黏合在一起,并且使酶活中心构象发生改变,导致底物分子的结合更加稳定。另外生化实验证明,变构位点的结合氨基酸突变会影响四聚体形成、dNTPase酶活性和对HIV-1的限制能力。

为了捕捉到SAMHD1同源四聚体的结构,需要在结晶条件中加入高浓度的dNTP分子,而且必须在晶体出现之后的24小时之内收集晶体衍射数据,否则dNTP会被持续降解,36小时之后晶体分辨率将急剧降低。借助于北京同步辐射装置的便利条件,该课题才能顺利得到所需的结构数据。这个例子显示出立足于同步辐射装置开展前沿结构生物学研究的优势。

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