实验室“迷你版”达尔文进化——定向进化

作者: 徐卉芳

来源: 中国科学院青岛生物能源与过程研究所

发布日期: 2020-12-22 07:30:00

本文介绍了定向进化技术的发展及其在生物工程领域的应用,特别是在绿色化工、生物能源、医药等领域的开创性成果。

从恐龙时代到人类现代文明,自然界生命万物无时无刻不在进化发展、繁衍生息。生物进化的基本环节可概括为:突变、选择(海选/选拨)、隔离(优秀选手单独培养)、优良性状的脱颖而出或物种形成。在这个过程中,随机的基因突变一旦发生,就受到自然选择的作用,但是新性状特征的稳定或物种的形成则可能需要上万年时间的演化。

随着科学的进步和基因工程技术的不断发展,科学家们不禁设想:是不是可以在实验室创造出各种可能的基因突变组合,来模拟和加速自然进化和筛选的过程?按需设计,对症筛选,快速得到我们想要的功能为人类造福呢?

带着这种思考,美国加州理工大学的Frances H. Arnold教授率先将这种想法付诸于实施,用于生物酶的定向进化(Directed evolution),并在绿色化工、生物能源、医药等领域取得了一系列开创性成果。她本人也因此获得2018年诺贝尔化学奖。

蛋白质是生命活动的执行者。酶(enzyme)也是一种蛋白质,是生物体内的高效催化剂,生命体进化了形形色色、功能各异的酶和蛋白质催化细胞内各种化学反应和新陈代谢过程(如食物的消化,毒物的分解,养分的合成,植物的光合作用等)。这些反应和功能帮助细胞更好的适应其特定的生存环境,也可被聪明的人类利用来生产各类化学品、抗生素和药物等,减少化学合成法的环境污染问题。

定向进化自发展以来广泛应用于基础科研、绿色化工和制药行业。不仅用于提升酶已知的催化特性,以更加绿色环保的方式来生产塑料、农药、燃料等;还赋予酶催化自然界从未有过的化学反应的能力,使其在工业上具有更广泛的应用潜力。如:提高酶在特殊环境下的稳定性和活性;改变酶的底物或产物范围;改变酶的对映体选择性;抗体的定向进化;催化新的化学反应。

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