发现鸟类适应青藏高原特殊环境的基因组学证据

来源: 中国科学院网站

发布日期: 2013-08-05 12:27:22

中科院动物研究所的研究团队通过对地山雀的全基因组测序与比较分析,揭示了地山雀适应青藏高原极端环境的遗传印迹,确认了其山雀而非鸦的分类地位,并发现与能量代谢相关的基因家族扩张及与免疫和嗅觉相关的基因家族收缩等适应性变化。

地山雀(Parus humilis)是青藏高原的特有鸟种,属山雀科鸟类。由于其形态特征与地鸦相近,曾长期被认为是鸦科鸟类,并被命名为“褐背拟地鸦”。中科院动物研究所动物进化与系统学院重点实验室雷富民研究员领导的鸟类学研究组与诺禾致源合作,对地山雀开展全基因组de novo测序,同时对另外两种山雀(大山雀和黄颊山雀)以及黑尾地鸦进行了重测序比较分析。

研究结果从基因组水平进一步确证了地山雀是“山雀”而非“鸦”的分类地位,并初步揭示了该物种适应青藏高原极端环境的遗传印迹。结果显示,地山雀与黄颊山雀、大山雀的亲缘关系很近,估算分化时间在7.7-9.9个百万年之间。

通过与原鸡、火鸡和斑胸草雀的基因组数据比较,发现地山雀基因组中与能量代谢相关的基因家族发生了扩张,而与免疫和嗅觉相关的基因家族发生了收缩;通过对7190个直系同源基因的比对,发现与低氧反应和骨骼发育相关的基因经历了正向选择以及不同程度的快速进化。上述结果进一步揭示了地山雀为适应青藏高原的特殊环境,产生了基本的生存适应策略演化,以及由山雀向鸦的形态特征转变。

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