尽管大熊猫与世无争，但在它们的栖息地领域，仍有一些与它们为敌的动物。此外，疾病侵袭、气候变化、竹子开花、生境破碎化等也都威胁着大熊猫的生存。
尽管大熊猫与世无争，但在他们的栖息地领域，仍有一些与它们为敌的动物，如金猫、豹、豺、狼、黄喉貂等，这些动物主要袭击大熊猫的幼崽和病弱年老的大熊猫。其中豺和豹主要袭击少年大熊猫或病弱老年个体；金猫常袭击大熊猫幼崽。
在自然状况下，疾病可能是影响大熊猫生存的最大危害，消化、呼吸、神经、造血系统的疾病往往是致命的，还会出现各种肿瘤，体内外寄生虫病和皮肤病以及外伤等，都会影响大熊猫的健康和寿命。
受气候变化的影响，未来80年大熊猫赖以生存的竹林中有1/3可能会消失，将对大熊猫的生存产生不可估量的影响。
在同一大熊猫栖息地区通常有1-2种竹子，竹子开花之后将会死亡，大面积的竹子开花将造成大熊猫食物缺乏，加之大熊猫栖息地相互隔离，当竹子开花死亡之后，大熊猫将不得不寻找其他食物，其中老弱病残的大熊猫可能会被淘汰，此时大熊猫种群数量将会下降。
大熊猫的分布区及种群数量日益缩减，最重要的原因是栖息地大量丧失，而且高度破碎。对大熊猫栖息地造成威胁的干扰按类型分为两大类：一是可能对大熊猫栖息地造成持久性或永久性影响的大型干扰，比如水利工程、矿山、高速公路、铁路、旅游景区、较大居民点等；二是影响范围有限、影响持续时间较短的一般干扰，比如放牧、采药、耕种、采伐等。
建立自然保护区。全国有大熊猫栖息地及潜在栖息地分布的自然保护区共计67处，其中有大熊猫分布的自然保护区共58处，自然保护区内野生大熊猫个体数量1246只，占野生大熊猫种群数量的66.8%，自然保护区内大熊猫栖息地面积130多万公顷。
实施重点工程——中国保护大熊猫及其栖息地工程。本底资源调查、基础设施建设、人员综合能力建设、保护宣传教育、大熊猫资源救护与监测、人工饲养繁殖；圈养大熊猫放归野外；减少大熊猫分布区的人类活动；完善野生动物保护法；建立大熊猫国家公园。