细菌的耐药基因是自然环境中新出现的一种潜在威胁。细菌获得耐药基因，将损坏抗生素治疗的效果。同时，耐药基因可通过水平基因转移（HGT）从一种细菌转移到另一种细菌。但是，目前水环境中耐药基因与细菌之间的相关关系尚不清楚。中国科学院武汉植物园水生植物与流域生态重点实验室环境基因组学学科组张卫红等在研究员杨玉义的指导下，通过相关性分析调查水环境中耐药基因与细菌之间的相关关系。
研究发现，aadA、tetM、mphA和tetA是水环境中主要的耐药基因。厚壁菌门（Firmicutes）可能是耐药基因的主要潜在宿主。此外，一些耐药性抗性基因在不同细菌之间可能通过遗传元件（MGEs）进行传递或交换。
相关研究成果以Large-scale pattern of resistance genes and bacterial community in the tap water along the middle and low reaches of the Yangtze River为题，发表在Ecotoxicology and Environmental Safety上。
研究工作得到中科院水生植物与流域生态重点实验室启动研究基金的支持。