近两年国家科技改革力度不断加强，在科技经费管理方面出台了一系列文件。中科院紧密结合国家和院发展改革新举措，在国家新出台的法规、制度框架内，结合中科院实际情况，在充分调研、广泛征求意见基础上，系统谋划科研经费管理制度建设，建章立制工作取得了阶段性成效。
为落实《国务院关于改进加强中央财政科研项目和资金管理的若干意见》（国发〔2014〕11号）改革精神，不断探索中科院科研项目和资金管理规律，完善科研资源管理使用办法，加强对科研资金的监督和管理，落实党风廉政建设主体责任，提高资金使用效益，充分发挥科研人员的积极性和创造性，保障“创新2020”和“率先行动”计划的顺利实施，中科院提出了加强科研项目和资金管理的《指导意见》。