山茶科木荷属超级条形码研究获进展

作者: 蒋银子,余香琴

来源: 中国科学院昆明植物研究所

发布日期: 2022-07-30 08:00:16

中国科学院昆明植物研究所与国内外学者合作,对木荷属植物进行基因组浅层测序,研究了传统条形码与超级条形码在木荷属植物的鉴定效率。结果显示,超级条形码在木荷属中的鉴定成功率较低,呼吁开发更多核基因条形码片段以应对复杂的进化历史。

准确的物种鉴定和划分是分类学与系统学的核心内容,也是植物资源利用和保护的重要基础和生物多样性研究的基石之一。在植物分类学家紧缺的背景下,DNA条形码应运而生,即利用较短的标准DNA片段对物种进行快速、准确鉴定的方法。亚洲特有属木荷属隶属于APG系统的杜鹃花目山茶科,约20种,我国分布有13种。

近日,中国科学院昆明植物研究所东亚特征植物分类与系统演化专题攻关组与国内外学者合作,对采自中国、尼泊尔和缅甸的12种58份木荷属植物样品进行基因组浅层测序,获得了叶绿体片段和ITS序列的传统DNA条形码数据以及叶绿体全基因组和核糖体DNA序列的超级DNA条形码数据。研究表明,超级条形码并不能幸免于由类群本身复杂的进化历史带来的挑战。

科研人员呼吁基于新一代测序技术开发更多核基因条形码片段,用于木荷属及其他类似植物类群的物种鉴定及识别。相关研究成果以Species discrimination in Schima (Theaceae): Next-generation super-barcodes meet evolutionary complexity为题,发表在Molecular Ecology Resources上。

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