绿孔雀对东亚和东南亚的文化的传承具有重要意义，也是我国一级重点保护动物，被国际自然保护联盟评定为“全球性濒危”等级。绿孔雀曾广泛分布于中国南方至爪哇的广大区域，后经历剧烈的种群收缩，目前仅片段化分布于云南及东南亚的局部区域。绿孔雀种群衰退过程中的主要致危因素，尤其是气候变化和人类活动的相对作用，尚不清楚。
近日，中国科学院昆动动物研究所与中山大学、台湾“中央研究院”等合作，组装了首个绿孔雀基因组，并开展了种群基因组重测序。科研人员综合使用多种分析方法，揭示自新石器时代中期（~6000年前）以来的绿孔雀种群急剧衰退过程，种群缩减幅度达200倍。进一步的统计分析显示，历史气候变化对于绿孔雀的分布变迁没有显著影响，而人类活动强度则与其有效种群数量以及当前的存活状态（绝迹v.s.幸存）具有显著的负相关性。
结果表明，自史前以来的人类干扰是绿孔雀走向濒危的主要驱动因素。研究显示，绿孔雀的现存种群存在严重的近交现象，迫切需要加强栖地保护和生态廊道建设，以维持其应对未来环境变化的进化潜力。
当前，生物多样性正以空前的速度流失，威胁人类福祉，如何更有效地开展生物保护已成为全人类面临的共同课题，解析物种濒危机制有望为有效保护策略的制定提供科学依据。该研究以绿孔雀为研究案例，提供了一种综合利用多种信息（种群基因组学、历史标本信息、生态位模型和历史人类活动数据等）以探讨物种致危因素的分析框架，该方法在其他物种中的扩展应用有望为保护生物学提供新的思路。
相关研究成果以Population genomic, climatic and anthropogenic evidence suggest the role of human forces in endangerment of green peafowl (Pavo muticus)为题，发表在Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences上。
昆明动物所副研究员董锋为论文第一作者，昆明动物所研究员杨晓君、中山大学教授刘阳和台湾“中央研究院”博士洪志铭为论文共同通讯作者。研究工作得到中科院战略性先导科技专项（A类）、国家自然科学基金等的资助。图1.绿孔雀的分布及研究中的采样信息。图2.基于多种方法重建的绿孔雀的历史种群动态（a、b、c）以及历史标本（Museum，~50年前）与当前样本（Modern）的遗传多样性比较（d）。
MH代表中全新世（~6000年前）、LGM代表末次冰盛期（~2万年前），LIG代表末次间冰期（~12万年前）。图3.不同历史气候模型下的适宜分布面积动态。CCSM4和MIROC分别代表不同的历史气候模型。时间段缩写解释见图2。图4.时间尺度上的历史人类活动强度动态。人类活动指标包括（a）人口密度、（b）建筑面积、（c）农田面积和（d）牧场面积。蓝色和红色分别代表绿孔雀现存区及绝迹区的人类活动强度。