2016年度上海市科学技术奖励大会于2017年3月22日举行。一批优秀的创新成果和科研人员获得嘉奖。本年度，上海市科学技术奖共颁发265项（人），其中10人获青年科技杰出贡献奖，自然科学奖22项、技术发明奖30项、科技进步奖107项，国际科技合作奖2人。
中科院上海分院各研究所共6项成果，1位个人获奖，包括技术发明特等奖1项，自然科学一等奖3项，技术发明一等奖2项，青年杰出贡献奖1人。
技术发明特等奖项目名称：大尺寸高性能激光钕玻璃批量制造关键技术及应用。完成团队：中科院上海光机所胡丽丽研究员等。激光惯性约束聚变装置是实现可控聚变的两条技术路径之一，具有重大的国家战略意义。这一装置的核心材料——激光钕玻璃的连续熔炼技术是国际上公认难度最高的光功能玻璃制备技术之一，西方发达国家长期对我国严格实施技术封锁和产品禁运。
中科院上海光机所胡丽丽研究员带领团队依靠自主创新、实现关键技术突破，为我国具备独立研发大型激光装置的能力提供重要的材料支撑。
自然科学一等奖项目名称：DNA去甲基化的分子机理及生物学意义。完成团队：中科院生物化学与细胞生物学研究所徐国良研究员等。DNA去甲基化如何发生是长期被关注的科学问题，学术界对哺乳动物中是否发生去甲基化一直争论不休。中科院上海生化细胞所徐国良团队的研究小组首次从生化水平上勾画出一条DNA的主动去甲基化途径，《Science》期刊专评：“徐等的发现解开了长期困扰学术界的关于DNA去甲基化的奥秘。”
科技发明一等奖项目名称：分布式光纤振动传感技术及其重要安防应用。完成团队：中科院上海光机所蔡海文研究员等。
团队经过近十年的不懈努力，历经原理方法发明、关键技术与核心器件突破和设备研制，取得了具有自主知识产权的国际领先成果，率先实现了振动的分布式定量测量，解决了实际安防应用中复杂环境下扰动信号误报难以准确识别的难题，并建立了分布式光纤振动传感技术及其安防应用的完整技术体系，产品可以实现单机双通道80km的安全监测。