用大数据解析功能基因朋友圈

作者: 李晨

来源: 中国科学报

发布日期: 2023-01-03 08:41:15

华中农业大学李林课题组联合其他课题组,通过构建玉米多组学整合网络图谱,成功预测了一批重要功能基因,为玉米智能育种奠定了重要基础。

科学家利用经典遗传学手段,克隆并解析了一批重要的功能基因。然而,在功能基因组提出二十几年后的今天,水稻和玉米中克隆的功能基因仍不到其所有基因的10%,已克隆基因的新功能也在不断被发现。如何快速克隆功能基因、解析重要性状变异的分子机制,并全局解码重要作物的遗传变异奥秘,仍然面临巨大挑战。

华中农业大学作物遗传改良全国重点实验室、湖北洪山实验室教授李林课题组,联合该校杨芳课题组、严建兵课题组,研究构建了玉米第一代多组学整合网络图谱,涉及基因组、转录组、翻译组和蛋白互作组多个遗传层级的200万个网络关系,并利用机器学习方法成功预测了一批重要功能基因,鉴定出调控玉米开花期等重要性状的分子调控通路。相关研究成果近日在线发表于《自然-遗传学》。

中国农业大学教授田丰等当天在《植物学报》发表热点述评称,玉米多维组学整合网络的构建是玉米功能基因组学研究的重大进展,不仅为玉米重要性状新基因克隆、分子调控通路解析和玉米基因组进化分析提供了新工具,也为玉米基因组设计育种提供了重要基因资源和分子模块,为玉米智能育种奠定了重要基础。

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