屠呦呦获诺奖，在引发国人振奋的同时，围绕其科研成果以及相关荣誉的讨论也再次重返舆论中心。近日，北京大学科学与社会研究中心教授周程向《中国科学报》披露，2004年，屠呦呦及其青蒿素研究成果在参与泰国最高医学奖的评比过程中，存在“被报奖”的嫌疑。屠呦呦在“不知情”的情况下获奖，她为此拒绝赴现场领奖。
2004年1月，泰国国王普密蓬·阿杜德为研制出抗疟疾药物青蒿素及其衍生物的中国研究协作团队颁发泰国最高医学奖——玛希顿亲王奖，以表彰中国科学家的杰出贡献。屠呦呦的名字便在这个团队之中。
周程介绍，这份殊荣却让屠呦呦很气愤，她为此致信国务院有关领导，希望能够查处相关部门在泰国奖报奖中的弄虚作假行为。周程还发现，那张获奖者合影中的屠呦呦，与另一张屠呦呦的生活照在神情、姿势上都非常相似。
记者在周程所掌握的材料中还发现一份据称是屠呦呦写给有关部门领导的申诉信。屠呦呦在信中表示，鉴于国家有关部门的意见，以及某些“权威人士”一向以“合作研究”抹杀她们首先发现青蒿素的事实，不愿意将国内的矛盾暴露给国外，她所以未出现在2004年1月29日去泰国的受奖团中。
除了报奖过程部分申报内容涉嫌“伪造”，此次摘得玛希顿医学奖还引发了另一桩堪称中国科技史上的公案——奖金分配问题。
2004年3月，有关部门发文征求玛希顿奖奖金分配方案时，有人提议屠呦呦可以多分一些，但分配差额不宜过大，但这个提法引起了中医研究院中药研究所的不满。2005年1月18日，中国中医研究院中药研究所再次致信有关部门，重申了2004年4月7日的复函内容，也希望有关部门能贯彻国家政策，并参照泰国玛希顿医学贡献奖基金会的本意，对我国科学家给予合理的奖励。
2007年，事情出现了“转机”。获奖团队中的一名成员倡议，将奖金全部捐给重庆的某个少数民族地区青蒿生产基地，建立一个希望小学。周程称，至于奖金最后到底是如何分配的，不得而知，至今没有找到任何材料记录此事。记者就此段历史联系了相关研究者和当事人，但由于时间较为久远，许多具体细节仍有待进一步核实与调查。