人类泛基因组首个草图发布

作者: 赵熙熙

来源: 中国科学报

发布日期: 2023-05-13 20:00:02

《自然》发表了人类泛基因组参考的初稿,该研究来自47个遗传多样化个体,为人类基因组提供了更完整的图像。与GRCh38相比,利用这一草图,检测到结构变异的数量增加了104%。

5月10日,《自然》发表了人类泛基因组参考的初稿,这一集合旨在最终代表整个人类物种中尽可能多的DNA序列。该项研究组合的人群遗传物质来自47个遗传多样化个体,为人类基因组提供了更完整的图像。自2001年发布草案以来,人类参考基因组一直是人类基因组的支柱。但由于结构变异和替代等位基因的存在——有些在最初参考基因组中没有,单个基因组一直无法代表人类物种的遗传多样性。

在3篇论文的合集中,人类泛基因组参考联盟提出了首个人类泛基因组参考草图,以及两个以这一参考图为基础的新遗传学研究发现。泛基因组开发自47名祖先不同个体的阵列,为当下的参考人类基因组(GRCh38)添加了1.19亿碱基对和1115个基因重复。与GRCh38相比,利用这一草图,检测到结构变异的数量增加了104%,为人类基因组遗传多样性描绘了更完整的图景。

两篇同时发表的文章提出了使用人类泛基因组草图的相关发现。这些成果还只是人类泛基因组前景中的一个过渡阶段,该计划旨在获取350名个体的遗传多样性。加利福尼亚大学圣迭戈分校的Arya Massarat和Melissa Gymrek在同时发表的新闻与观点论坛文章中强调了这些进展的重要性,但提出还需持续改进以应对一些现有的挑战,如需要更多样化的取样。另有第四篇论文发表于《自然-生物技术》。

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