6月2日，救援人员在沉船现场救起一名幸存者。新华社记者肖艺九摄。此前媒体报道称‘东方之星’在沉船前右转，但实际上是发生了180度的左转调头。6月3日，上海海事大学副校长、上海海事司法鉴定中心负责人蔡存强在接受《中国科学报》采访时表示，由于目前龙卷风具体发生时间仍不确定，因此无法判断这样的“大逆转”究竟事出何因。
蔡存强表示，“东方之星”在21时19分开始第一次转向，21时22分继续转向，完成了一个180度的调头，然后开始反向运动，直到21时58分轨迹消失。他表示，一般情况下，船在正常行驶过程中不可能会采取180度调头的操作，即便是要躲避水流或浅滩，也只会做小5度的航向改变。
记者从中国交通通信信息中心的信息服务平台宝船网查询到，“东方之星”在21时19分45秒时，航向开始向东偏移了12度。21时20分16秒时航向为北偏东34度，航速为7节，56秒之后，航速减为4节，航向调整为北偏东10度。到21时22分42秒时，航速下降为3节，航向突然转为西南方向，而21时22分41秒时，航速降为1节，并发生了180度的逆转，航向改为东南。
蔡存强分析，龙卷风是逆时针旋转，如果龙卷风是从船的右侧吹来，那么这条船在龙卷风的影响下，马上发生了大5度的左转，左转了1分钟以后，再调头过来，正好符合龙卷风逆时针旋转的轨迹。但如果这段时间不是龙卷风发生的时间，就要另当别论了。
根据6月2日下午18时中国气象局发布的数据，事发当日21时06分，监利县出现最大瞬时风9.2米/秒；22时03分，监利县东南方向靠近长江边的尺八自动气象站（距出事点约35公里）最大瞬时风16.4米/秒。21至22时监利站雨量64.9毫米。蔡存强说，龙卷风究竟是在21时21分左右发生的，还是在28分以后发生的，仍然没法确定。
上海海事大学商船学院教授肖英杰告诉记者，一般来说，当船舶遇到大风时，在抵抗风浪的过程中，航向最好能够迎风并与风偏15度左右。不过，蔡存强判断，尽管目前尚不能完全排除人为操作失误的可能，但因人为操作不当造成沉船的可能性并不大。
记者了解到，目前被救起的船长和轮机长已被长航公安部门控制。