2月3日,记者获悉,为共同抗击疫情,“上海光源”特别开通“新型冠状病毒研究专项课题”绿色通道,并于2月2日提前开机,助力科学家深入了解新冠病毒微观结构、打开新冠病毒感染人体的“黑匣子”。记者2月2日在上海同步辐射光源官网“用户开放—运行实时状态”一栏也看到,BL17U1、BL19U1、BL19U2等线站均处于“Open”状态。“上海光源”是目前全球性能最好的第三代中能同步辐射光源之一。
它像一台超级显微镜,帮助生物学家破解着一个个“蛋白质之谜”。疫情当前,解析病毒关键蛋白的结构至关重要——受访专家告诉《中国科学报》,开发阻断病毒入侵的药物、找到新冠病毒可能的中间宿主、指导新冠病毒疫苗的研发等与疫情防控相关的重大发现,都将与这项工作密不可分。受访专家目前正利用上海光源开展新型冠状病毒蛋白结构解析工作。
为尽快取得成果,在连线中施一表示,自1月初第一株新冠病毒基因组序列发布,他们就开始了这项工作,“春节也没有休息”。结构解析关注三环节。《中国科学报》:利用上海同步辐射光源,如何解析蛋白结构?齐建勋:首先需要目标蛋白形成蛋白晶体,蛋白晶体在同步辐射X-光照射下发生衍射。获得衍射数据以后,我们再用专门的软件去解析蛋白质的结构。如果数据质量好的话,就可以得到它的三维结构。
《中国科学报》:我们需要解析新冠病毒哪些蛋白的结构?施一:上海光源提供同步辐射光源大科学装置利器来帮助解析新型冠状病毒关键蛋白的结构基础,将推动我们对新型冠状病毒的深入认识。新冠病毒的基因组大概有30kb,大概3万个碱基。病毒不同的蛋白质在感染过程中会执行不同功能。但在病毒感染宿主细胞时,一般分为3个环节:入侵、病毒基因组的复制和转录、组装。
其中,入侵指的是,病毒进入宿主细胞;之后,病毒在宿主进行基因组的复制和转录,转录形成的mRNA会利用宿主细胞的蛋白表达系统去生产病毒蛋白;其后新合成的病毒蛋白和复制出来的病毒基因组进一步发生组装,形成新的病毒粒子,分泌出去后再去感染新的宿主细胞。我们团队主要针对病毒感染这三个环节中的关键蛋白,进行解析。