评价是指挥棒，科技界为人所诟病的各种问题归根结底是导向出了问题。7月3日晚，两办印发《关于深化项目评审、人才评价、机构评估改革的意见》（以下简称《意见》）的消息一出，科研圈集体“炸锅”了：“国家层面的政策很好很及时，希望主管部门能尽快落实到位。”“力求创造公平公正的科研环境，评价机制和激励机制也再进一步完善。”……“三评”改革涉及的都是科研人员特别关心的问题，他们对此次出台的新政有何看法和期待呢？
《意见》在基本原则中明确提出，坚持分类评价。“这很难得。”北京师范大学全球变化与地球系统科学研究院院长程晓接受《中国科学报》记者采访时表示，期待可以破除教师、工程师甚至临床医生都惦记着发SCI论文的怪现象。《意见》还提到，探索建立对重大原创性、颠覆性、交叉学科创新项目等的非常规评审机制。程晓认为，这一点非常重要，“尽管非常规评审确实不好做，但是要探索”。
不过，中科院科技战略咨询研究院副院长张凤直言：“落实起来还是有些困难的。”科研单位有基础的、应用的、高技术的、军民融合的……对人、对项目、对机构的管理评价模式都不一样。“中科院实施了研究所分类改革试点，有些尝试，但实际上难度还比较大。”张凤认为，真正要把《意见》实施下来还是要触及各个管理部门的利益，需要有一些衔接的机制，路还很长。
《意见》提到，国家实验室等全职科研人员及团队不参与申请除国家人才计划之外的竞争性科研经费，由中央财政给予中长期目标导向的持续稳定经费支持。中科院亚热带农业生态研究所党委书记王克林认为，这个导向十分必要。以德国马普学会为例，稳定的经费支持占90%，只有10%是竞争性科研经费。而中科院目前稳定经费支持和竞争性科研经费大体各占一半。
王克林接受《中国科学报》记者采访时表示，在持续稳定经费支持方面，我们呼吁中央财政把中科院这样的国立科研机构的预算拨款的比例提升到80％，这样科研人员才能安心科研，持续解决国家重大需求和重大问题。
《意见》指出，科学设立人才评价指标。突出品德、能力、业绩导向，克服唯论文、唯职称、唯学历、唯奖项倾向，推行代表作评价制度，注重标志性成果的质量、贡献、影响。
“没有‘帽子’、没有奖项就好像低人一等，这挫伤了很多科研人员的积极性。”中科院理化研究所研究员刘静无奈地说，“确实需要从制度上进行顶层设计，纠正这些不合理现象。”程晓认为，推行代表作评价制度，可以抑制论文“灌水”，鼓励科研人员出一些大文章。“如何客观、正确地评价科研成果很重要。”刘静表示，我们要学会识别潜在的、有重大意义的成果，国外没有相关研究，不代表自己的科研工作毫无意义。
如果只是跟随欧美发达国家做研究，长期下去，中国永远不可能有一流的原创性科研成果。
针对科研机构的评估，《意见》提出，完善国家科技创新基地评价考核体系。根据优化整合后的各类国家科技创新基地功能定位、任务目标、运行机制等不同特点，确定合理的评价方式和标准。“这是对中科院知识创新工程以及‘率先行动’计划四类机构建设的国家层面政策肯定。
”王克林表示，对于社会公益性创新基地单元的评价，一方面科研机构的成果要为政府中长期规划、重大政策制定提供可以采纳的科学依据，研究示范工作能够为政府主管部门重大行动提供引领性现场示范；另一方面科研机构也要为国家企业创新联盟或者骨干企业提供重大技术支持。