人类和狗有着长久而美好的关系，但我们如何走到一起的故事已被时间的沙尘所掩埋——所以我们并不确切知道我们成为朋友有多久了。
根据新的研究，我们早在11000年前就开始了狗的驯化之路。通过仔细测序古代狗的DNA，研究人员发现，在最后一次冰期结束时，至少有五种不同的遗传谱系。
他们还测序了同时代人类的DNA，以追溯我们两个物种在几千年间的相互关系。
研究人员表示，这些早期谱系是我们今天所知和喜爱的许多不同狗的基础。
“如果我们回顾四五千年前，我们可以看到，在狗的多样性方面，欧洲是一个非常多样化的地方，”英国弗朗西斯·克里克研究所的遗传学家安德斯·伯格斯特罗姆说。
“尽管我们今天看到的欧洲狗有着各种各样的形状和形式，但从基因上讲，它们只源自曾经存在的多样性的一个非常狭窄的子集。”
我们知道所有的家养狗（Canis familiaris）都是从与今天的灰狼（Canis lupus）共享的狼祖先那里进化而来的。但确切地说，这种分歧发生在何时一直存在争议。有些人声称驯化——缓慢地繁殖狼以选择更友好的特征的过程——始于100000多年前，尽管这种解释是有争议的。
通常认为狗的驯化始于40000到20000年前之间。而且，这个过程可能始于狼本身在接近人类定居点时自我驯化。
很难区分早期狗的化石和古代狼的化石，这项新工作并未声称何时或如何开始犬类驯化——因此它不会解决任何关于这一切是如何开始的疑问。
但它确实揭示了关于人类和狗共享历史的迷人新信息。
古代狗的DNA来自32只不同年龄的动物，从100岁到10900岁不等，来自西伯利亚、欧洲和中东。其中五只狗的基因组之前已经测序过；该团队为迄今为止最完整的古代狗DNA研究测序了27个新的基因组。这些基因组与来自世界各地的现代狗基因组进行了比较。
这就是团队发现早在11000年前至少有五种不同的狗谱系的方式——他们将这些描述为新石器时代的黎凡特、中石器时代的卡累利阿、中石器时代的贝加尔湖、古代美洲和新几内亚唱歌狗。因此，驯化过程必须在那之前很久就开始了。而且，这些谱系的痕迹可以在今天的狗中找到。
例如，藏獒有强烈的青铜时代草原和新几内亚唱歌狗谱系的混合。吉娃娃和Xoloitzcuintli有古代美洲谱系的痕迹。巴辛吉斯有强烈的新石器时代黎凡特谱系的贡献。而新几内亚唱歌狗今天仍然可以在野外找到。
有趣的是，似乎没有狗和狼之间的来回基因流动。先前的研究表明，随着两个物种的分化，它们继续杂交，这有助于早期狗的多样性。它们确实继续杂交，但基因流动似乎主要朝一个方向——从狗到狼。
今天的狼狗杂交种确实存在，这可能是这种单向基因流动的线索：这些杂交种是不可预测的，通常是野性的，不适合与人类一起生活。
为了重建狗和人类在历史上的关系，研究人员还将古代狗的DNA与17个生活在与狗相同地点和时间的人类的基因组进行了比较。
在许多情况下，狗和人类的DNA都发生了类似的转变。研究人员得出结论，这些可能是生活方式的变化，例如从一个地方迁移到另一个地方。这是有道理的：当人类迁移时，他们带着他们的犬类BFF。这可以解释为什么例如，来自中东的狗和中东的人类同时出现在欧洲。
但这些变化并不总是对齐的。有时人类群体发生了变化，但狗没有。这表明狗可以在人类群体之间移动，或者可能是宝贵的贸易商品。为什么存在这些差异仍然是一个谜，可能需要更多的古代狗DNA来解决。
但有一件事非常清楚：狗和人类已经彼此非常喜欢了很长时间。
“狗是我们最古老、最亲密的动物伙伴，”英国牛津大学的古基因组学家格雷格·拉尔森说。
“使用古代狗的DNA正在向我们展示我们的共同历史有多远，并最终帮助我们理解这种深厚的关系何时何地开始。”
该研究已发表在《科学》杂志上。