像酿啤酒一样酿造青蒿素,它做到了

作者: 刘陈立

来源: SELF格致论道讲坛

发布日期: 2020-03-03 18:56:29

本文介绍了合成生物学的基本原理和应用,包括如何利用合成生物学技术生产药物如青蒿素,以及在医药、食品、能源、健康等领域的应用。文章强调了通过建造生命去理解生命的理念,并举例说明了合成生物学在医学上的具体应用,如生产大麻素治疗癫痫和用细菌生产胶水。

合成生物学虽然还不能从头去造一个生命体,我们对它的基础原理还不是很了解,只是刚刚起步。但是现有的技术和对生命的理解,已经能够让我们做一些事情,运用在医药、食品、能源、健康等各个方面。

刘陈立是中国科学院深圳先进技术院合成生物学研究所所长,深圳合成生物学创新研究院院长。他提到,自然界中丰富多彩的物种,包括我们自己都是从一个细胞慢慢生长、发育变成一个复杂又非常美丽的个体。这个过程不是人类干预的过程,是自然界的演化过程,我们能不能理解它,甚至是掌握它呢?

薛定谔在《生命是什么》一书中提到,生命其实是有序的,是有法则可依的。朱熹老先生也说过格物致知,所以第一部分内容是造物致知。费曼先生说只要这个事物我不能造出来,我就不理解。合成生物学家说能不能通过建造生命去理解它呢?

这些美丽的图案,有斑马的条纹、老虎的条纹,它们是怎样从一个细胞通过生长、发育,形成这样漂亮的图形的呢?如果人类自己去建造、去设计这样的图形,要怎么做呢?这是北京奥运会时的图片,一种做法是把人排成一排排后,站在固定的位置,然后翻牌。另外一种做法是大家跑到固定的位置,然后形成固定的形状。这两种我们凭直觉想出来的方法,其实自然界也在用。

作为合成生物系统,我们是不是可以简化它,去掉那些冗余的信息,只留存最基本、最核心的信息,就是让它产生最核心的本质的结构呢?为了做这件事情,我们再简化一点,我们不用细胞,而采用细菌。细菌非常小,像大肠杆菌只有1微米大(1微米是1毫米的千分之一),要在显微镜下才能看得见。我们把这个细菌接种在一个培养皿上,这个培养皿差不多10厘米大小,这个细菌会生长,变多,逐渐占满整个培养皿。

如果我们从其他的物种借一些基因,加入一些设计放到这个细菌中,我们再将这样的一个细菌放到培养皿里,它就能够自己生长、发育,变成这样一个条纹的状态。

生物界中还有一个很有意思的问题,这种重复性的条纹的数量是有严格控制的,比如说马的蹄子只有一瓣,犀牛的蹄子为三瓣,人的手指有5个,如果长出6个来就认为是不正常了。所以这个数量是严格调控的。刚才我们看到的这些条纹,能不能调控数量呢?如果我们再给它改变一个基因,就发现只要调控这个基因的量的多少,它的数量就可以从5个调到2个,或者是1个,甚至没有,非常简单。

还有一个有趣的问题,就是重复结构的大小。长颈鹿的颈椎和人一样都是七块,但它的颈椎比我们长很多,这个长度到底是由什么决定的呢?我们又改变了一个基因。我们发现只要改变这个基因,条纹或者是重复结构的大小,就能够很容易进行变化。

上述我们从其他物种借一些基因加到一个细菌里,用某种机制,让它得到一个有序结构,能够帮助我们理解背后的普适的原理。刚才举的例子是单种细胞,也就是单个细菌,它自己形成了条纹的结构。

而胚胎,它的细胞有不同的种类,比如皮肤细胞在外面,然后肌肉细胞在皮肤下面,还有骨骼、血管在里面,等等,它总是在不同的位置分布。作为合成生物学家,我们就在想,怎么让不同的细胞在空间上的不同位置分布呢?假设我有5种细胞,能不能让这5种细胞去生长、运动,让它能够在空间上占领不同的位置,形成外一层、里一层,再到中间这样的位置呢?

我们通过实验完成了,5个细胞点上去,不用理它,它自己就可以生长,然后分布在不同的位置。

格物致知就是传统的生物学,自上而下的,比如发现这片叶子之所以形成这个形状,它背后的基本原理或者是可能的作用机制。造物致知就是自下而上的,自己设计一个机制,让它长出一个有点像我们自然界看到的那些形状的生物结构。这有两个启示。

一个是自然界中的这些类似结构背后的机制跟我们人脑想出来的,凭直觉自己设计出来的机制,可能是相通的。第二个启示,我们并不关心自然界,它形成这个结构是因为怎样的原理或者是怎样的机制。作为合成生物学家,我们要造一片叶子,用我们自己设计的机制发现了这个原理就可以了。只要它的结构和功能一样,我们可能就满足了。

我们现在的技术能够做什么?我们可以对它进行改造。比如说让它发光,这是现在可以做到的。

当然现在可能不够亮,如果够亮,或者我们能够控制它的话,也许我们能够创造一个像《阿凡达》一样的世界。我们再畅想一下,也许能够把城市中的路灯全部换成发光的树,白天不亮,晚上按一个开关,树就自己亮了,整个城市将节约很多电。这是一种改造。还有另外一种改造。合成生物学改造生命体常用的就是青蒿素。青蒿素是从植物黄花蒿里面提取出来的,黄花蒿的种植可以说是靠天吃饭,产量不稳定,价格也不稳定。

美国的一位教授把黄花蒿里面的基因放到酵母菌中,酵母菌比前面讲到的那个细菌大五六倍,有5到10微米。他把酵母菌放到发酵罐里,像酿啤酒的方式来酿青蒿素。可以说黄花蒿大部分的植株是没用的,因为含有青蒿素化学成分的只有一点点。我们就让这个酵母只干生产青蒿素这件事儿,这个事情已经做成了,已经在服务社会了。

最近,我们研究所的一位老师罗小舟,在美国的实验室工作时,做的一项工作是把大麻里面的基因放到了微生物里,让微生物直接生产大麻素这一类的药物镇定剂,像CBD。

下面这位小朋友叫夏洛特,她得了癫痫,每个月要发作300次。但是如果吃了大麻素的有效成分CBD,就会减缓症状,每个月只发作10次。这就是用合成生物学技术来生产这些农业来源的药物的一个例子。

第二个例子,我的好朋友钟超教授在用细菌生产胶水,这个细菌能够不断繁殖,也就是说这种胶水永远用不完,自己会生长,你要用的时候加一点铁离子,它就凝固了,而且在水下面也可以用。还有一个例子,我另外一个朋友叶海峰教授做的一项工作。图中这只小鼠得了糖尿病,他把一团能够分泌胰岛素的细胞,包裹在一个微胶囊里面,然后把这个微胶囊植入小鼠的腹腔。小鼠只要喝茶,就能诱导胶囊里面的细胞分泌胰岛素。只要喝茶就等于吃药了。

这是最近的一项工作,也是合成生物学在医学上的一个运用。

目前,合成生物学虽然还不能从头去造一个生命体,我们对它的基础原理还不是很了解,只是刚刚起步。但是现有的技术和对生命的理解,已经能够让我们做一些事情,运用在医药、食品、能源、健康等各个方面。现在国外比我们发展快一些,中国刚刚起步。

可能最厉害的、最佳的合成生命体的设计师就是伟大的中国古代劳动人民,他们设计了龙,龙是鹿脚、狮子头、鳄鱼的嘴巴、蛇身、鱼鳞、虎掌、鹰爪合成而来。中华民族真是充满想象力和创造力的民族,让我们一起造物致知。

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