DNA双链断裂通常被认为是一种极具危害的基因损伤形式,但它在一些正常的细胞过程中也能发挥关键作用。DNA双链断裂被认为是一种极其危险的DNA损伤,通常与癌症、神经退化和衰老有关。但一些神经学家发现,大脑神经元中的DNA双链能在多处裂开,以帮助逃避危险和快速学习。这个“走钢丝”一样的过程在人体中可能十分普遍,而人体如何平衡这一过程,以及它带来的好处和后果正在一一被揭示。
面对威胁时,大脑必须迅速采取行动,神经元之间需要迅速建立新的连接,以区分出生存与死亡的差异。但是,这个反应过程也会增加大脑中的一些风险因素:正如一项近期研究发现,为了更快地学习和记忆,大脑中神经元会在多个关键的地方撕裂DNA,然后再修复断裂的基因组。这一发现不仅为我们了解大脑的可塑性提供了一些见解,它还表明,DNA断裂可能是一个常规且重要的细胞过程。
这一发现对我们如何看待衰老和疾病、如何看待通常被视为由于运气极差才会出现的基因事件,具有启示意义。
这一发现令人惊讶的原因是,DNA的两条链同时在一个位点断裂,是一种特别危险的基因损伤,通常只与癌症、神经退化和衰老有关。与其他类型的DNA损伤相比,DNA双链断裂更难以修复,因为没有一个完整的模板来指导双链的再次连接。然而,早有研究表明,DNA双链断裂有时也会发挥积极的作用。
当细胞分裂时,双链DNA断裂使得染色体之间能进行正常的基因重组。在免疫系统的发育过程中,DNA片段之间能通过重组,产生各种类型的抗体。双链断裂也和神经元发育有关,它能帮助表达某些特定的基因。尽管如此,这些功能似乎只被认为是细胞中的一些特例,DNA双链断裂仍是被认为是意外,不为科学界所接受。
但是,这个故事在2015年出现了一个转折点。
当时,麻省理工学院皮考尔学习与记忆研究所的所长、神经科学家Li-Huei Tsai和同事正在跟进之前的研究工作,这些研究显示阿尔茨海默病与大脑神经元中DNA双链断裂的积累有关。令人惊讶的是,研究人员发现刺激培养的神经元,会促使它们的DNA双链断裂,而这种断裂会迅速增加12个和突触活动相关的、快反应基因的表达,它们均与学习和记忆有关。
双链断裂在调节基因表达方面,具有十分重要的作用,而基因的活性对神经元的功能至关重要。Tsai和同事推测,DNA双链断裂实际上会释放吸附在扭曲的DNA双链上的酶,使它们能够快速转录断裂处附近的相关基因。
虽然如此,澳大利亚昆士兰大学的博士后研究员Paul Marshall和同事还是决定跟进这一研究。2019年,他们发表了一项研究成果,证实并进一步补充了Tsai团队的观测结果。
结果显示,DNA双链断裂会引发了两波基因转录增强,一波是即时的,另一波发生在断裂数小时后。Marshall和同事提出了一个两步机理来解释这一现象:当DNA断裂时,一些酶分子能被释放出来,用于进行基因转录。断裂位点处的DNA会被甲基化,这是一种常见的表观遗传标记。随后,当受损DNA开始修复时,这些甲基化标记会被移除,在这一过程中,更多的酶会脱离DNA链,开始第二轮转录。
近期,在一项发表于PloS ONE的新研究中,Tsai和同事表明,这种违背直觉的基因调控机制,可能在大脑中普遍存在。这一次,他们没有研究培养的神经元,而是观察了活体小鼠脑部的神经元,这些小鼠正在学习将一个环境与电击联系起来。他们在绘制受到电击的小鼠的前额皮层和海马体神经元中、双链断裂附近的基因图谱时,发现近数百个基因附近都发生了双链断裂,其中许多基因参与和记忆相关的突触过程。
然而,同样有趣的是,在没有受到电击的小鼠的神经元中,也会出现了一些DNA双链断裂的情况。
为了进一步支持这一结论,科学家们还发现在大脑的非神经元细胞——神经胶质细胞——中也存在DNA双链断裂的情况。在神经胶质细胞中,这一过程能帮助调节不同类型的基因的表达。这一发现表明神经胶质细胞在记忆的形成和储存中发挥了作用,此外还显示了DNA断裂可能参与调控许多其他类型的细胞中的基因表达。
即使DNA断裂是一种特别快速的、诱导关键基因表达的方法,但它产生一定的风险,使得细胞无法履行记忆巩固等细胞功能。如果DNA双链断裂一次又一次发生在相同的位置并且没有得到适当的修复,遗传信息可能会丢失。除此之外,Tsai说:“这种类型的基因调控可能使神经元的基因组更易遭受损伤,特别是在衰老和神经元中毒的情况下。”
随着科学家更好地理解人体内这一机制的细节和用途,最终它们或可以促进一种新的医学疗法的发展。Marshall表示,考虑到DNA双链断裂在基本的记忆过程中的重要性,仅仅试图防止这一过程可能不是正确的方法。但这项工作还表明,我们需要停止以静态的视角来看待基因组,而开始把它想象成一个会动态变化的事物。Marshall说道:“无论何时你利用、扰乱或改变DNA模板,这可能并不一定是一件坏事。
”他和同事已经开始研究一些调节异常、有害症状或疾病(如出现癌症)相关的、其他类型的DNA变化。他们已经发现了DNA变化在其中发挥的一些关键作用,还能调节基本的和记忆相关的过程。Marshall认为,许多研究人员仍难以将DNA双链断裂视为促进基因转录的一种基本的调控机制。他说:“它还没有获得广泛关注,人们仍然认为这只是一种DNA损伤。
”但他希望他的研究和Tsai团队取得的新成果“将为其他人打开一扇门,促进更深入的研究。”