高性能计算在药物研发的若干环节发挥着重要的作用，包括利用基因测序提供帮助、潜在药物靶标的研究、苗头化合物的发现、先导化合物的确定和优化等，甚至还能为后续的临床实验等工作提供一些支持。大家好，非常高兴来到“格致论道讲坛”。我是来自中国科学院信息网络中心的金钟，主要是做高性能计算方面的研究，专业是高性能生物医药计算。今天主要是想和大家谈一谈高性能计算和生物医药计算。
今年是非常特殊的一年，大家也都处于新冠疫情中。疫情来得非常之快，我们和疫情、病毒在赛跑，这也是科研和病毒的竞赛。当疫情来的时候，我们怎么办？首先，我们可能要想办法去治疗，治疗的时候需要有药物。在突然疫情来临的时候，找药物最重要的是什么？速度。速度是现在找药的关键，有了超级计算机的帮助，可以使发现药物的速度比原来快很多。我们一定听说神农尝百草的故事。古人得病的时候没有药怎么办？只能硬抗。
神农看到大家非常痛苦，于是他去深山里面尝遍了百草，最后得到了365种草药，写成了非常重要的药典。但后来神农非常不幸地在尝药过程中，因中毒去世了。用人尝药是非常危险的，而且它的效率非常低。现代怎么办？我们现在有了超级计算机的帮助，有了对药物分子和药物机理的研究。研究清楚以后，我们就幸运了，不需要我们亲身去试验，先用计算机帮忙。超级计算机是一个庞然大物，非常非常大。
我们现在用的超级计算机可以占满一间屋子。超级计算机占地面积几百平米，甚至比这更大。紫杉醇是一种抗肿瘤药物，下图右侧是我们计算和实验的对比，做的是紫杉醇搭载在药物载体上，进入体内不断缓释发挥作用的过程。当它注入到人体后，66分钟起开始释放，一直到二三十分钟后，这个药才能真正的在体内发挥作用。