2020年4月30日，自然指数年度榜单（Nature Index 2020 annual tables）发布，展示了不同国家和科研机构在自然科学领域高质量科研产出的情况。美国依然位于首位，中国居第二位，但不断在缩小差距，中国2015年以来科研产出有大量增加。其它年度产出居前十位的国家是德国、英国、日本、法国、加拿大、瑞士、韩国和澳大利亚。
数据显示，美国经调整后的贡献份额（Share）自2015到2019年下降了10%，而中国则增加了63.5%，是增长最快的国家。
与前几年一样，中国科学院、哈佛大学和德国马普学会依然位居机构产出的最前列。但是，也出现了一些意料之外的结果。例如，中国科学技术大学经调整后的贡献份额增加了25.6%，令其位次较前几年有大幅提升。
中国科学院位居机构首位，其贡献份额是哈佛大学的两倍，占自然指数总份额的2.8%，并且在化学、物理、地球和环境科学这三个学科领域的产出均居于全球首位。哈佛大学的生命科学研究产出在全球居首，该学科的实力支撑了该校在总体产出中的领先位次。该校是学科排名跨度最大的机构之一——其生命科学位居第1，而化学居第33位。
其他2019年贡献份额居前十的机构还包括：法国国家科研中心、美国斯坦福大学、美国麻省理工学院、德国亥姆霍兹国家研究中心联合会、中国科学技术大学、英国牛津大学和北京大学。
此外，今年的自然指数年度榜单还增加了机构上升之星榜单，该榜单追踪2015至2019年各机构高质量科研产出的增长情况。中国在该榜单居主导地位，前44家机构上升之星全部来自中国。其中，中国科学院大学经调整后的贡献份额增加了242%，这反映了该校在过去四年发表的高质量科研成果有显著的增加。
自然指数创始人David Swinbanks说：“自然指数年度榜单显示，获得良好资助的大型知名机构继续在自然科学领域的高质量科研产出上有强劲表现。但我们也看到规模较小、更年轻的机构也非常有可能迅速上升，与那些更资深、地位更稳固的机构并驾齐驱。年度榜单是显示自然科学领域高质量科研产出的一个良好指标，但我们鼓励读者在考量科研质量和机构表现时也同时使用其它的科研产出指标，如数据、软件和知识产权等。”