2020年2月11日,世界卫生组织宣布了新型冠状病毒肺炎官方正式命名为 COVID-19,21日国家卫健委决定与世界卫生组织保持一致,中文名称不变。随着关于新型冠状病毒病毒疫情的不断发展,有关疫情的各类信息也在不断更新。OpenKG 紧随疫情发展,继续发布新领域的新冠知识图谱,同时对已经发布的图谱进行持续不断的更新。
本次主要新增清华大学和妙医佳健康科技联合构建的新冠健康图谱、浙江大学与华为云联合构建的病毒药物和病毒亲缘关系等图谱、河海大学与小米人工智能实验室构建的新冠热点事件图谱,武汉科技大学等单位构建的新冠物资、IBM 中国研究院等构建的流行病学图谱 (实例数据更新中)。
同时来自同济大学、浙江大学、东南大学、海乂知信息科技、文因互联、小米人工智能实验室、复旦大学等分别更新了百科图谱、科研图谱、临床图谱、英雄图谱等部分的数据。近期我们还将发布新冠防控图谱。OpenKG 发布的所有新冠知识图谱都基于统一的命名规范和语义格式,采用 CC-by SA 相似署名开放许可协议,供大家免费下载使用。持续更新,敬请关注!
此外,在 OpenKG 的知识图谱众包平台 OpenBase 上,我们还将展开新冠知识图谱众包,欢迎大家为高质量的中文知识图谱贡献力量。
新冠百科图谱包括病毒、细菌、流行病、传染病等相关实体。作为新冠领域知识图谱的基础,图谱以病毒、细菌为主体,扩展了治疗,疾病等相关内容,通过了这些概念的百科知识,形成了新冠百科图谱。除了新冠相关的实体外还涵盖了过往疫情。潜在应用:面向新冠相关术语的语义检索、智能问答,并可用于新冠相关文档的智能搜索和推荐。科研图谱新增病毒药物、病毒亲缘关系、新冠病毒基础信息三个数据库和数据集,并更新病毒分类图谱。
在第一阶段的发布版本中,我们从病毒的生物学分类角度出发,以 NCBI 美国生物信息中心 Taxonomy 板块下的数据为基础,构建了一个病毒的族系网络——病毒分类图谱。该图谱具有较大的规模,其中实例的数量达 20w 以上,三元组的数量更是达到了 190w+。但是其在分类及族系关系以外未引入其他信息,具有一定的局限。
通过与医药、生物学相关科研人员的交流及合作,从专业的角度了解病毒差异的来源以及区分/联系不同病毒的重要属性;同时,通过与华为云语音语义创新 Lab 及华为云医疗智能体团队开展合作,从不同科研内容角度展开多方面的工作,期望通过双方深入的交流及合作,共同构建并完善用于科研用途的知识图谱。
新冠健康图谱由清华大学和北京妙医佳健康科技联合构建,包含跟新冠肺炎相关的各类疾病、药物、症状、检查、全国各地接收新冠肺炎定点医院等信息。潜在应用: 流行病调查研究,基于图谱的新冠肺炎健康防护问答。新冠物资图谱包含防控新型冠状病毒所需要的各类物资,主要包括医用防护装备、日常防护用品、医用诊疗设备以及治疗用药。
其中,医用防护装备包含了医用手套、口罩、隔离服等;日常防护用品包含洗手液、消毒用品等;医用诊疗设备包含常规检查设备和氧疗设备;治疗用药包含了《新型冠状病毒感染的肺炎诊疗方案》多个版本中的中、西药品。示例问题问:在疫情期间,如果出门买菜,带哪种口罩比较好?答:选择医用外科口罩、N95 口罩、KN95 口罩即可,但是目前医用口罩比较稀缺,建议供应给一线使用。
新冠肺炎流行病学知识图谱包含了流行病学知识图谱 Schema 和基于此 Schema 定义的新冠肺炎资源实例 (待更新)。其中流行病学知识图谱 Schema 重点刻画流行病学的基本概念、流行病学调查等内容,未包含“流行病学研究方法”、“预防与控制策略”、“临床治疗与预后”等内容,需要在后续版本中与其他新冠肺炎知识图谱集成或连接。
新冠肺炎资源实例包含了发生在 2019 年~2020 年 2 月期间,COVID-19 疫情中确诊患者的流行病学调查数据,这些数据来自中各省市卫健委公布的个案流调信息。新冠流行病学图谱可以助力对流行病调查、溯源、密切接触者追踪,为医护人员和疾病防控人员提供技术支持,加速流行病调查研究。
新冠热点事件图谱支持对新冠病毒事件在时间轴上的正向和反向索引,事件本身发展脉络的枚举和事件的查证溯源。后期会在数据层面上加入对事件的谣言鉴别基础功能的支持。
临床图谱从目前已有的规范文件入手,基于诊疗规范 (流行病学+症状+实验室指标+治疗)、研究进展 (测序、药物开发、疫苗)、发病统计 (丁香园),将研究进展与科研相关联。图谱以新型冠状病毒(COVID-19)为核心延展至病毒、治疗方案、症状、方剂等各类概念,形成新冠临床知识图谱,可基于图谱进行知识问答。
新冠英雄图谱包括了医疗专家组、因公殉职英雄、武汉当地和全国各地的意见领袖等,涉及生平事迹和基本属性,并与新冠百科、新冠科研、新冠临床、新冠防控等图谱中的一些概念或实体关联。图谱以新冠病毒专家为核心延展至履历、成果、事件、战役等各类概念,形成新冠英雄知识图谱,可基于图谱进行英雄人物动态展示。