找到新冠病毒的中间宿主，对于进一步理解和预防疫情发生有显而易见的重要意义。香港大学管轶公布来自穿山甲的病毒序列，可能支持穿山甲是中间宿主，但也有科学家认为证据不足。广东两个课题组公布其研究结果，一个认为很可能是穿山甲，一个认为不是。看来穿山甲是否中间宿主暂时没有定论。但是，所有几个课题组都发现穿山甲携带冠状病毒，无论穿山甲是中间宿主、原初宿主还是最终受害者之一，食用和偷运穿山甲都有巨大风险。
华南农业大学的学者在bioRxiv上抛出了论文，指出穿山甲可能是新冠病毒的中间宿主。此前的2月7日，华南农业大学、岭南现代农业科学与技术广东省实验室教授沈永义、肖立华等科研人员曾召开发布会，认为穿山甲或为新型冠状病毒的潜在中间宿主。
尽管蝙蝠可能是各种冠状病毒的宿主，但2019-nCoV是否还有其他宿主仍然不清楚。
在华南农业大学的这项研究中，沈永义、肖立华等研究者从马来穿山甲中分离出出了一种与2019-nCoV高度相关的冠状病毒，它的四个编码结构蛋白E，M，N和S基因分别与2019-nCoV表现出100％，98.2％，96.7％和90.4％的氨基酸同一性。特别地，穿山甲冠状病毒的S蛋白的受体结合结构域实际上与2019-nCoV的S蛋白受体结构域相同，只有一个氨基酸的差异。
不过，广东省生物资源应用研究所的分析显示，虽然通过分子和系统发育分析表明穿山甲冠状病毒与2019-nCoV、蝙蝠冠状病毒都有遗传相关性，但不支持2019-nCoV直接是从穿山甲冠状病毒来的。2月21日，陈金平等人在bioRxiv上发表了这一结果。
金冬雁认为，关于穿山甲是否为中间宿主，无论是华南农业大学的研究，还是广东省生物资源应用研究所的分析，“都有道理，可能另有中间宿主，但都没有证据。”
无论是香港大学管轶团队和其合作者、华南农业大学的作者，还是广东省生物资源应用研究所的作者，他们都认为要遏制冠状病毒等引发的重大传染病暴发，严格地禁止穿山甲非法贸易，保护野生动物很有必要。