2019年12月31日，首批国家卫健委医疗救治专家团队成员抵达武汉，对新型肺炎进行重症救治攻关。1月1日金银潭医院现场照片显示，专家组成员按“空气传播隔离措施”进行防范。北京时间1月30日凌晨，美国医学期刊《新英格兰医学杂志》上线了一篇关于武汉新型冠状病毒的流行病学研究论文，瞬间引发舆论关切。
有批评者认为，论文提到的“2019年12月份即在密切接触者中发生了人际传播”，显示包括来自中国疾病预防控制中心（CDC）在内的论文作者至少在1月初已经掌握了明确的人传人的证据，但外界直到1月20日才了解到病毒可人传人。也有科学家表示，该论文属于流行病学回顾性研究，数据采集和分析都是滞后的，为何一定要推演到“隐瞒疫情”。
这篇题为“新型冠状病毒感染肺炎在中国武汉的初期传播动力学”的文章，作者来自中国疾病预防控制中心、湖北省疾病预防控制中心、香港大学等十几个机构。论文对截至2020年1月22日已报告的、经实验室确诊的425例病例的数据进行了流行病学分析。作者们发现，这些患者的中位年龄为59岁，56%为男性。
在2020年1月1日前发病的病例中，55%与华南海鲜批发市场相关，而此后发病的病例中，仅8.6%与华南海鲜批发市场相关。病毒的平均潜伏期为5.2天，每例患者平均将感染传给了另外2.2人。“根据这一信息，有证据表明，自2019年12月中旬以来，密切接触者之间已发生人际传播。”论文的结论部分写道。
然而，这一“结果新颖”的研究在网上引起了轩然大波。浙江大学教授王立铭在微博上评论称，该研究显示病毒的人际传播力2.2，这一数字显著低于SARS冠状病毒，也吻合世界卫生组织之前的预测（1.4-2.5）。王立铭指出，即使用最粗糙的分析，也看得出“在1月初的头几天，和华南海鲜市场无关的患者数量就开始占据绝对多数。病毒人际传播的迹象已经非常非常明确了！”
中国CDC的回应称，“及时在学术刊物发表调查结果，有助于国内外专业同行及时了解疾病的特征，共同评估和研判疫情，改进防控策略。”然而，关于该论文，一个普遍的质疑是：中国疾病预防控制中心，是否有因为发论文而未能及时公开数据？发表论文是否会影响到数据与其他公共卫生管理部门分享？
尽管中国CDC的声明解释了所有病例在论文撰写前已向社会公布，但一个绕不开的问题是：中国CDC是否在何时了解到新型冠状病毒可人传人，何时了解到15名医务人员感染病例？是否尽到了自己的职责？对此，中国CDC的声明并没有说明。