巴西圣保罗研究基金会（FAPESP）成立于1960年，是巴西最大的地方政府资助机构，旨在支持圣保罗州的高等教育和科研发展。2017年，FAPESP总资助经费约5.23亿美元。作为州立基金会，其体量已经超过了巴西国家科技发展委员会（CNPq）的年预算5亿美元。FAPESP能够保持稳定的收入来源，主要得益于巴西宪法的一项规定，即各州税收的1%属于基金会，并由政府按月向基金会拨款。
圣保罗是巴西经济最发达的城市，人口占全国总人口数量22%，国民生产总值达到全国35%。在较强经济实力支持下，其科研实力也为各州翘楚。圣保罗州拥有博士学位的科学家数量占全国三分之一以上，在国际期刊发表的文章数量达到全国总数的一半。能够以一州之力取得此成果，离不开FAPESP等科研机构的大力支持，其公平、高效的同行评审体系尤其功不可没。
第一，完全以科学家为评审主导。FAPESP的资助类型包括助学金项目和研究项目两大类，所有项目都要经过评审才能获得资助。在评审过程中，有4核心参与主体，即学科专家组、项目专家组、评审专家、监督委员会。四个核心主体均由科学家组成，负责完成评审工作；而科学部管理人员和学科主任则负责协调、监督和流程制定。
第二，三重把关的评审程序。首先，由州内活跃的高级研究人员组成的学科专家组每周都会在FAPESP召开会议，目的是为受理的申请书指派评审专家。经过半个世纪的发展，FAPESP形成了一套独特的基于科学家为主导的同行评审体系。所谓科学家为主导是指评审环节和整个评审过程完全由科学家主导完成，基金会人员只负责流程上的协调和监督。
第三，建立专家档案辅助指派。为了确保准确性和高效率，FAPESP为每位评审专家都建立了评审档案，除学术内容以外，还记录了该专家参与以往评审的情况，为指派工作提供有效信息。
第四，良性对话机制提高整体资助率。当申请人对评审结果存在异议时，可以要求复审。一般FAPESP会请初审专家对申请人提供的复审材料进行再评审；在必要时，请其他评审专家参与复审。
若申请人有足够理由质疑评审专家的意见，则可申请直接与科学主任进行对话，向其提出更换评审专家。这种对话机制为评审专家和申请人创造了一个有效沟通的机会。很多情况下，通过对话沟通，申请人了解到评审专家对申请书的建议，修改原申请书，最终获得资助。正是由于这种对话机制的存在，FAPESP的项目整体资助率达到了40%。