近年来，似乎越来越多的研究发现某种特定的肠道微生物群与某种疾病之间存在联系。然而直到最近，几乎所有这些研究都在孤立地研究单个疾病。但大多数情况下人们会同时拥有不止一个健康问题，用医学术语来说就是“合并症”。在一篇刚发表在《自然-通讯》期刊上的论文中，作者研究了一系列疾病的肠道微生物组成，并发现了令人惊讶的结果。那些被认为会在某种疾病中增加的微生物种类，在调查的所有38种疾病中几乎都显示出了增加。
此外，一些被认为是“健康的”肠道微生物，在研究的这38种疾病中都出现了相应地减少。
从肥胖症到焦虑症，大量的病情似乎都与我们体内的微生物有关。这项研究所使用的是来自英国双胞胎项目TwinsUK的数据。TwinsUK是英国最大的一个成人双胞胎登记项目，参与者会分享他们的健康史以及许多生物样本，已有超过25年的历史。这些已成年的志愿者像大部分人一样，随着时间的推移而累积了一些健康问题。在记录的2700例记粪便样本中，研究人员发现其中96％的人具有一个或多个的健康问题。
新的分析中最引人注目的发现是这些微生物并不会只针对某一种疾病，而是针对普遍的健康状况。每个微生物喜欢的环境都非常具体；任何能改变它的东西，甚至是微小的改变，都意味着会使一些敏感的微生物会无法生存。例如，结肠内部有着惊人的低氧（厌氧）环境。许多疾病会导致轻微的炎症，这些炎症会造成微小血管的打开，从而让白细胞进入包括肠道在内的组织中。
白细胞会将氧气作为武器，因此在白细胞的影响下，结肠中的氧气水平会升高。这对在严格的厌氧条件下生长的正常肠道细菌来说可能是具有毒性的。
普拉梭菌群就是一种听起来很可怕但其实非常友好的菌类，它们在任何疾病中几乎都会遭到毁灭。科学家还尚不清楚丧失这些友好的微生物会对人体健康造成怎样的连锁效应。它们或许只是身体健康的标志，又或许它们对健康能起着积极的作用。如果它们确实对身体健康有益，那么医生将需要在疾病过程的早期就对它们进行干预，以保持这些友好的微生物能存活。这可能会涉及到对益生元和益生菌的同时服用。
未来，研究人员甚至可能找到一种方法来分离我们肠道中的健康肠道细菌，让它们在肠道外生长。一旦培植的细菌足够多，就可以将它们重新引入我们的肠道，以增强我们的健康。健康肠道细菌的个性化组合可能比任何随机植入我们体内的有益细菌都更容易在肠道中存活。在新的论文中，有一类细菌在研究的所有疾病中都表现出了增加，那就是肠杆菌科。
它们能在比正常结肠更高的氧气环境中存活，这其中还包括可以让你真正生病的细菌，例如大肠杆菌。同时，它们还含有大量耐抗生素基因。
细菌可以通过彼此传递一些特殊基因以在抗生素的攻击中存活。因此，如果结果发现携带这些基因的细菌也存在于患有多种疾病的人体内，那么就会对我们在如何控制感染的同时又为患者提供安全、有效的护理方面产生影响。例如，将一群易受感染的人聚集在一个医院中，可能会给具有毒性的细菌菌株的进化创造更多机会。我们可能需要投入更多的资金，以安全地在这些病人自己的家中进行治疗。
新的研究结果表明，更清晰的了解我们体内携带了什么将让我们从中获益。具体来说，有两个方面：首先，微生物是反应我们整体健康的一种优秀的感应器。因此，在未来，我们可能会考虑通过非处方的粪便测试来监控我们的整体健康状况。如出现厌氧菌突然降低这一类的早期预警，将可以帮助我们将这些问题扼杀在摇篮；而相继进行的测试可以告诉我们任何已经采取的行动是否有效，如果没有，我们就可以迅速改变策略。
其次，定期对人体体内的微生物进行普查，特别是那些与耐抗生素基因有关的微生物，将对我们非常有益。虽然与之相关的科学研究仍处于起步阶段，但了解我们与这些微生物的关系，或许将有助于在我们真正需要抗生素时对它们进行保护。