中、美、苏、英、法、印、澳等11国指派的法官齐聚东京后，法官的座位排序就引发各方瞩目。在梅汝璈看来，任何国家场合，座次绝非个人私事，而是关系到国家地位和荣誉。法庭上，澳大利亚法官韦伯是经盟军最高统帅麦克阿瑟指派的庭长，庭长右边的第一座位属美国法官。至于其余座次如何排列，尤其是庭长左边的位置该安排谁，法官们各执一词。同盟国诸国中，中国遭受侵略最早、受害最惨，理应排在第二位。
但弱国无外交，中国代表团的合理建议并未被庭长韦伯所采纳。开庭前一天预演时，韦伯突然宣布入场顺序为美、英、中、苏、法，梅汝璈当即表示坚决抗议，并毅然脱去法袍，拒绝彩排。他说：“今日预演已有许多记者和摄影师在场，一旦明日见报便是既成事实，既然我的建议在同仁中并无很多异议，我请求立即对我的建议进行表决。否则，我只有不参加预演，回国向政府辞职。
”由于梅汝璈的据理力争，法官们进行了最后表决，决定中国法官安排在庭长的左侧位置，中国国旗则插在最中间的位置，从而为国家赢得了尊严。