基因编辑技术不仅在医学上有很大的用途，在农业应用中也能大显身手，基因编辑技术不仅能让我们吃饱，而且还能够吃得更好。
很多人都吃过西红柿。有人喜欢切片沾糖凉拌，有人喜欢西红柿炒蛋。但大家有没有注意过，市场上能买到的西红柿分好几个品种，有的又大又甜，有的又小又酸，还长得歪瓜裂枣的。这些差异源于西红柿不同的基因调控。基因就像一本教科书，告诉西红柿应该怎么长。既然西红柿不是生来就注定被人类吃掉，它们的基因教科书自然也不会教它们怎么更容易地被人吃掉。
水稻是中国人的重要主食，科学家也不懈地进行水稻品种改良。家喻户晓的袁隆平院士致力于通过水稻杂交技术得到了超级水稻，解决了亿万人口的吃饭问题。现在有了CRISPR技术，新型水稻品种的研发也如虎添翼。
CRISPR不仅能直接修改基因，来优化农作物的果实，还能通过其他的方式保护农作物的茁壮成长。很多昆虫会将农作物作为食物，影响农作物的正常生长。
由于昆虫会自己分泌抗菌肽而抵抗各种病原菌的感染，所以在自然条件下的昆虫对周围环境有很强的抵抗力，法国的科学家Emmanuelle Jacquin-Joly将CRISPR技术用于防止虫害。他们将一种鳞翅目害虫的特定气味感受分子从基因组中敲除，并发现70%的后代可以遗传这种突变。
CRISPR也能让一些观赏植物变得更加丰富多彩。牵牛花颜色由一个色素催化相关基因（DFR-B）控制，相当于对应基因教科书中的一行，把它删掉后，牵牛花花瓣就从高贵的紫色变成了纯洁的白色。而通过进一步的基因修饰，可通过精确控制色素酶表达量的多少，来决定牵牛花的颜色，或者通过基因改造来达到不同的颜色，这是多么神奇。