我们的科技计划在体系布局、管理体制、运行机制、总体绩效等方面都存在不少问题，突出表现在科技计划碎片化和科研项目取向聚焦不够两个问题上。
要彻底改变政出多门、九龙治水的格局，坚持按目标成果、绩效考核为导向进行资源分配，统筹科技资源，建立公开统一的国家科技管理平台，构建总体布局合理、功能定位清晰、具有中国特色的科技计划体系和管理制度，以此带动科技其他方面的改革向纵深推进，为实施创新驱动发展战略创立一个好的体制保障。
科技计划体系一直是科技界的一个重要命题，特别是长期以来科技计划中存在的上下左右重复、分散、封闭、低效等现象，成为科技创新中的巨大阻碍。造成这一现象的原因，部分是因为现有科技计划体系都是在历史发展阶段的特定需求中产生的，这些计划都在当时产生了一定的积极作用，但随着形势发展，其改革的急迫性也越来越凸显出来。
破局的关键在于统筹整合，管理层面要打破过去各自为界的局面，支持渠道层面整合原有的各类科技计划，关键要将陆续出现的“打补丁”式的分散计划进行规划修改，形成布局完整、优势互补、分工明确、界限清晰、有机统一的计划体系。科技立项不要一味跟踪国外热点，而要着眼于经济与社会发展的远近重大需求。其次要着眼于全链条的科技创新、一体化组织实施，要提高立项门槛，加大对人的资助力度。
在这个过程中，应该保持信息公开透明、各地各级各部门及时通气，保证全局不紊、改革稳进。
我国的科技计划主要包括基础研究计划、国家科技支撑计划、高技术研究发展计划、科技基础条件平台建设、政策引导类计划等。经过多年的理论研究和实践探索，我国已经初步形成一个较为完整的科技计划体系。然而必须承认，现行科技计划体系面临着时代发展带来的不断挑战。长期以来，我国科技计划存在重复、分散、封闭、低效等现象。
据统计，我国目前有近40个部门管理着近百个中央财政科技计划（专项、基金等）。“跑部钱进”、多头申报、“九龙治水”“天女散花”等问题阻碍了科研效率的提升和我国科技水平的进一步提高。
当前，随着科技体制改革不断推进，科研院所转制、课题制、科技评估、招投标等制度的实施，都对科技计划体系的整体性、针对性、灵活性、高效性等提出了更高要求。如何让科技计划体系跟上市场经济、科技发展的步伐？
首先应当进一步加强顶层设计和系统规划，凸显全局意识和大计划概念，保证不同部门、领域和环节之间的顺畅衔接；其次要精细管理、突出重点，针对不同性质的创新主体制定最适合的计划；最后注重风险控制，完善科技计划的保障体系。目前，新时期科技改革的主体架构和主要政策已基本建立，新科技计划体系已初步成型，2017年也成为全面按照优化整合后的新科技计划体系运行的第一年。
下一步，全面完成科技计划管理改革任务，发挥新科技体系面向世界科技前沿、面向国家重大需求、面向国民经济主战场的作用，将成为科技计划改革的重点。