百迈客: 引领生物信息学产业 2.0 时代

作者: 吴兰

来源: 科研圈

发布日期: 2017-08-07

百迈客生物科技有限公司作为生物信息学产业的先驱,通过其创新的“百迈客云”平台,引领生物信息学服务进入2.0时代。该平台通过大数据的可视化分析,使得科研工作者能够更深入地解读基因数据,推动了生命科学研究的进步。

基因大数据的可视化分析正带领生物信息学服务进入2.0时代。生命科学与信息科学已经发生了不可割裂的融合。随着基因测序技术成本大幅下降,基因数据大量积累,生物信息学产业进入跨越式发展阶段,革新着我们的健康与医疗。但变革最大、获益最多的,仍是科研领域。一个面向生命科学工作者的信息服务产业应运而生。作为中国最初一批生物信息学创业公司,成立于 2009 年的百迈客生物科技有限公司在这场变革中扮演了重要角色。

经过八年的发展,百迈客沉淀下了丰富的科研成果与技术产品,也对生物信息学产业的未来产生了深刻的洞见。在接受《环球科学》采访时,百迈客董事长及 CEO 郑洪坤以“基因科技服务2.0时代”,定义和描绘了生物信息学产业当下的发展方向。

首先尝试生物信息学新技术的是科研领域,这个市场目前相对成熟,商业模式相对清晰、需求稳定,公司比较多,对技术类型的要求会更加多样化。

第二便是与医疗检测相关的生物信息学业务,包括肿瘤、遗传病的检测和用药指导,以及产前检测。这一类业务,知识积累比较完善,已经有成熟的技术,需求市场早已存在。面向个人的生物信息学业务,更多偏向健康管理,这部分业务市场潜力较大,但相对来说,目前用户对这类服务的需求并不刚性,发展速度也相对较慢。

生物信息学是随着高通量测序技术发展起来的。百迈客成立之时是高通量测序进入稳定和快速发展的初期。

当时测序成本高,数据种类和数据量少。近年来测序的成本急速下降,数据种类和数据量因此指数级增长,这是最大的变化。成本降低为行业创造了机会。八年前,国内真正从事生物信息学的企业只有几家,现在发展到几百家,市场竞争更充分,对企业核心竞争力的要求变得更高了。百迈客因此瞄准了生物数据解读领域,以及生物云、特别是基因大数据的可视化分析,这是我们目前在国内领先的核心业务。

生物信息学服务的 2.0 是百迈客第一个明确提出来的。1.0与2.0的不同表现在两个方面 :第一是数据的规模,第二是数据分析的可视化程度。1.0 阶段数据量较少,服务以人工为主,用户只能用自己的数据进行分析。发展到 2.0 阶段,科研领域可用的基因大数据大概在十几个 P 的量级。

2.0时代,科研工作者不仅需要服务公司帮助解读数据,更希望自己可以进行更深入的解读 :2.0模式的内涵,就是将生物信息工具可视化,让所有人都有能力挖掘基因大数据。我们因此搭建了一个 2.0 的生物信息学服务系统 :百迈客云。

之前的工具或者平台,最大的特点是单纯的工具性。生命科学研究者只知道自己的研究目的,很难理解这些工具的本质。

比如他们可以找到美国国立生物技术信息中心(NCBI)的小工具,但在面对复杂的生物信息学问题时,往往不知道该以什么样的方式使用哪些。“百迈客云”根据八年的服务经验,提炼出用户对分析工具的需求,按照一定的逻辑,把工具分类、整合展示出来。做生物信息学研究时,研究人员需要的工具不会跳出这些分类,因为这是成千上万的科学家一同思考和创新的结果,只是最后由我们开发成了产品。

我们从高通量测序的数据作为出发点,目前大概设计了二三十个产品,包括转录组、小RNA、环状RNA、linkRNA、外显子、目标区捕获、遗传图谱、全基因组关联分析等,涵盖了与高通量测序相关的全部主流分析。科研人员对生物信息云产品的接受度不断上升,“百迈客云”目前已经积累了一万多名科研用户,这些用户总体的反馈比较积极,也配合我们的技术团队、生物信息团队、技术服务团队,参与到 产品的迭代优化中。

基因大数据与科研服务相结合的模式,已经对生命科学研究产生了明显的支撑作用,下一步我们会继续向海外推广服务。

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