国务院总理李克强6月1日主持召开国务院常务会议。会议指出，深入贯彻全国科技创新大会精神，形成充满活力的科技管理和运行机制，推进科研领域“放管服”改革，更大调动科研人员积极性、创造性，对于实施创新驱动发展战略，推动大众创业、万众创新，落实“三去一降一补”任务，培育新动能，增强发展内生动力，迈向创新型国家和世界科技强国，具有重要意义。
会议确定，一是简化中央财政科研项目预算编制，将直接费用中多数科目预算调剂权下放给项目承担单位。项目年度剩余资金可结转下年使用，最终结余资金可按规定留归项目承担单位使用。二是大幅提高人员费比例。增加间接费用比重，用于人员激励的绩效支出占直接费用扣除设备购置费的比例，最高可从原来的5%提高到20%。对劳务费不设比例限制，参与项目的研究生、博士后及聘用的研究人员、科研辅助人员等均可按规定标准开支劳务费。
三是差旅会议管理不简单比照机关和公务员。中央高校、科研院所可根据工作需要，合理研究制定差旅费管理办法，确定业务性会议规模和开支标准等。四是简化科研仪器设备采购管理，中央高校、科研院所对集中采购目录内的项目可自行采购和选择评审专家。对进口仪器设备实行备案制。五是合理扩大中央高校、科研院所基建项目自主权，简化用地、环评等手续，对利用自有资金、不申请政府投资的项目由审批改为备案。
同时，要落实和研究完善股权激励政策，建立科研财务助理等制度，精简各类检查评审。高校和科研院所要强化自我约束意识，完善内控机制，确保接得住、管得好，营造更好科研环境。
李克强在全国科技创新大会、两院院士大会、中国科协九大第二次全体会议上发表讲话。他谈到科技创新需要体制机制改革来激活，引发会场四千多名两院院士和科技工作者代表的共鸣，讲话被掌声数次打断。
李克强指出，政府在基础研究上的投入比国外、比发达国家要少，为子孙后代想，为把经济迈上中高端想，现在财政比较困难，再困难这方面也只能增加不能减少。李克强强调，要推进科技创新中的“放管服”，要给科研院所和高校开展科研更大的自主权。政府有关部门确实有着不必要的干预太多，卡得太死。事实上，世界上一流的科研机构、一流的高校、一流的科技成果，从不是靠政府部门的工作人员管理管出来的。
李克强还提到，要精简程序、简化手续，把科研人员从繁琐的表格中解放出来。同时，要借鉴国际通行做法和国内相关经验，提高间接费用和人头费用比例，承认人才和智力劳动的价值。李克强表示，要完善保障和激励创新的分配制度，探索年薪制、股权、期权、分红等激励措施，提高科研人员成果转化效益分享比例，让他们凭自己的聪明才智和创新成果合理合法的富起来。
李克强强调，尊重劳动、尊重知识、尊重人才、尊重创造，这不能只放在口头上，更不能口惠而实不至，讲了就必须做，而且一定要做到，真正让有贡献的科技人员名利双收，经济上有实惠、工作上有保障、社会上受尊重。