昆虫不仅直接取食尸体，还能帮助各种微生物进入尸体内，加快其分解。除了这种“清道夫”角色，昆虫在法医学上的作用也不容小觑。早在南宋，宋慈所著的《洗冤集录》一书中，就记载有根据蝇类辨识出带有血腥气的作案凶器之事，这是有关法医昆虫学的最早文献记载。法医昆虫学目前已经成为一个比较系统的学科，推断死亡时间、伤口部位、移尸情况都不在话下。
尸体上常见的昆虫多达5目67科，其中以双翅目和鞘翅目最为重要，最常见的是丽蝇科。它们有的直接以尸体为食，如丽蝇科和麻蝇科，它们是推断死亡时间的常用物种。还有一些昆虫捕食尸食性昆虫，如隐翅甲科和阎甲科，它们通过减少尸食性昆虫的数目而延缓尸体分解速率。此外，蚂蚁、马蜂、跳虫、蜘蛛、恙螨等也可在尸体上发现，它们在法医上应用并不多，不过在有些案件中还是大有用武之地。
1983年，美国南加利福利亚的警官在检查一具白人女尸时发现其脚踝和腰部有凸起的红点，特别像恙螨叮咬的痕迹。而当时恙螨的分布区域有限，凶手和死者可能同在野外某一地点出现过，身上可能有类似的斑点。果然，在犯罪嫌疑人身上也发现了这样的红点。进一步调查确认其为凶手。
蝇类的发育要经历四个阶段。在常温下，卵期的发育时间一般持续1-2天。蝇类的幼虫俗称蝇蛆，可细分为三个龄期，共持续6-10天左右。蛹期一般持续一周至十几天。最后由蛹羽化为成虫。不同种类的蝇，其发育速度也不一样。除此之外，影响尸体上蝇蛆种类和发育速度的因素还包括温度、湿度、光照、尸体情况等。
法医昆虫学家的工作之一就是收集尸体上的昆虫，鉴定其种类和发育阶段，考虑可能的影响因素，并以此推算出可能的死亡时间。通常有的虫子在现场会被沸水杀死，保存在乙醇中用于将来分析；另一些则被送到培养室，在合适的温度下进行培养，进一步确认其发育阶段。
死亡超过3天后，普通的病理学家就很难推断准确的死亡时间了，而利用蝇蛆推断的死亡时间可达十天半月，甚至长达几个月。著名的 Ruxton一案就是法医昆虫学的成名之作。昆虫学家通过尸体上的蝇蛆，推断死亡时间约为12-14天，为嫌疑人的定罪提供了关键证据。