肥胖患者易患糖尿病的原因比较复杂，从目前的研究结果来看，主要是因为过度堆积的脂肪使体内胰岛素的敏感性大幅下降，促使自身胰腺超负荷工作，代偿性地分泌更多胰岛素以维持血糖稳态，久而久之，自身胰岛功能会慢慢衰退甚至枯竭。由此可见，减重对预防肥胖人群发生糖尿病至关重要。
根据日常生活经验，我们不难发现，有些人既有糖尿病，同时又有高血压和血脂异常，这种人多半是胖子。医学上称这种现象为代谢综合征，而肥胖则是代谢综合征的主要表现之一。不同的肥胖类型中，与代谢异常关系最密切的是腹部脂肪的积聚。腹部脂肪包括两个部分，即内脏脂肪和皮下脂肪。研究发现，内脏脂肪较多的人更容易得糖尿病、代谢综合征等代谢性疾病。
同样，非酒精性脂肪性肝病，医学上认为是代谢综合征在肝脏中的表现，也是肥胖的副产品之一。现在许多中老年人都会有脂肪肝，说起来也许有些轻描淡写，但其实，如果不加以控制，非酒精性脂肪性肝病患者还会发生糖尿病，并与冠心病等疾病伴发，需要引起足够的重视。
与肥胖密切相关的代谢异常，最终会导致心血管疾病，所以我们也可以说，肥胖与心血管疾病密切相关，是一对“孪生兄弟”。肥胖之所以大大增加了心血管疾病发生的风险，是因为肥胖导致高胆固醇血症、高血压、高血糖，以及其他一些病理变化，诱发动脉粥样硬化，导致血管狭窄，产生心脏供血不足，累及心脏、脑，发生冠心病、脑卒中。
肥胖可引起激素分泌异常，并导致相应的功能及代谢紊乱。如肥胖女性因卵巢功能障碍可引起多毛症和月经紊乱，甚至发生不孕；肥胖男性因雄激素减少、雌激素增多，重者可表现出不育。这些症状可在体重减轻后得以改善。
肥胖者常伴有腰、腿痛，其骨软化的发生率也较非肥胖者高，严重者可影响关节活动。同时肥胖者由于长期体重负荷过重、活动减少，腰椎、膝、踝关节骨质增生的概率也比正常人高。
肥胖者因体重增加而耗氧量增加，但肺功能却没有进一步随着体重的增加而增强，同时，肥胖者腹部脂肪堆积又限制了肺的呼吸运动，故可造成慢性缺氧和呼吸困难。中度肥胖者可有胸闷，活动时气短，重度肥胖患者因颈部脂肪过多，舌体肥大，舌根后坠，睡觉常会打鼾，出现睡眠时阻塞性呼吸暂停，有猝死的风险。
前面已经提到，肥胖者的甘油三酯在肝脏中蓄积，从而形成非酒精性脂肪肝，而且肥胖者容易并发胆固醇结石，40岁以上的肥胖妇女胆石症发病较多。
肥胖还常易并发乳腺癌、直肠癌、前列腺癌及胰腺癌等疾病。