2014年初，理化学研究所（RIKEN）的小保方晴子团队在《自然》上发表两篇论文，称将新生小鼠体细胞暴露在弱酸性环境中，能够使细胞恢复到未分化状态。这种被称为“STAP”的细胞多能性获取技术迅速引起广泛关注。然而由于论文本身存在诸多问题，《自然》在今年7月2日宣布撤回这两篇STAP论文，小保方晴子也身陷学术不端的审查风波。
4月1日，理化学研究所调查委员会认定小保方晴子存在捏造、篡改等学术不端行为。7月17日，小保方晴子攻读博士时的早稻田大学也宣布调查结果，称小保方晴子的博士学位论文中存在6处违规。然而校方表示取消学位的规定在此情况中不适用。
然而不到三个月，早稻田大学便改变了态度。10月7日，早稻田大学校方宣布将要取消小保方晴子的博士学位，但由于是校方让存在问题的论文通过了审查，因此大学方面也负有一定责任。因此，虽然理应取消小保方晴子的博士学位，但校方还是选择暂缓这一举措。
取消学位一事将暂缓一年执行，小保方晴子将有一年的时间对论文进行修改并再次提交。校方表示，如果小保方晴子重新提交的论文能通过审查，那么她原有的博士学位将被保留。小保方晴子的律师表示，小保方晴子将遵从学校的决定，会在这一年中修改论文并重新提交。
早稻田大学的相关人员也将受到相应的惩罚。首当其冲的是小保方晴子的博士论文导师常田聪。由于当时没能把好审核关，他将受到停职1个月的处分。而其他与小保方晴子博士学位相关的老师，也将受到训戒惩罚。校长大人镰田薫也将自己五个月工资津贴的20%自觉上缴，小保方晴子读博时所属的研究科科长则上缴了自己三个月工资津贴的20%作为惩罚。