近亲繁殖给赛马带来灾难。中国科学报 2014-07-01 20:50:06。California Chrome这样的纯种马开始更多地近亲交配。最近的基因研究发现，这些动物正变得更相似，并且为马类血统制造了潜在危险。数量越来越少的快速种马却要产下越来越多的马驹，一些兽医认为近亲繁殖会伤害纯种马血统。
同时，赛马的不景气也减少了新纯种马驹的登记数量，从1986年的5.1万匹到2013年的2.3万匹，这让基因库更加萎缩。纯种动物始于近亲交配：它们的父系起源可以追溯到18世纪初英格兰3个种马中的一个。那时，种马配种后所付的种马费依赖于种马的速度和它们能在多大程度上制造出其他获胜者。
该体系一直持续到上世纪80年代中期，当时NorthernDancer的种马费激增到了100万美元，并且1年大的马驹能卖到1300万美元。这些钱带来了一种新的空中旅行者——“飞行种马”，它们在春季繁殖期飞到不同半球。但为速度进行的繁殖与选择健康和持久性的繁殖不同。今天最快的纯种马的瘦腿和小蹄子有更大的肌肉平衡，这导致头重脚轻的马的四肢很容易在高速奔跑中折断。
随着近亲交配的增多，许多纯种马开始退出比赛并提前退休，这激发了人们对这些马持久性不够的广泛猜测。一些饲养员表示，与其他品种相比，纯种马有更少的隐性疾病，但Finno并不同意，并表示研究经费还未真正用于寻找相关基因。基因技术可能会提供帮助。自2007年马基因测序后，Finno提到，“研究出现激增”，发现了由基因突变引发的35种疾病和由单个基因带来的特征。
她正在寻找年轻纯种马呼吸疾病以及神经轴突营养不良的基因原因。另外，研究人员开发出含有7万个DNA序列的马基因芯片，用于扫描与疾病和毛色等有关的基因。到今年年底，一个芯片预计会拥有67万个序列。世界各地的饲养者开始使用遗传学检验赛马的运动基因。相关基因能够控制马的肌肉发育，并能预测一匹马是更适合短距离冲刺还是长距离奔跑。